Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC23IPQ9Y6Y8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC23IPQ9Y6Y8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC23IPQ9Y6Y8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC23IPQ9Y6Y8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC23IPQ9Y6Y8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC23IPQ9Y6Y8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC23IPQ9Y6Y8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC23IPQ9Y6Y8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC23IPQ9Y6Y8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SEC23IPQ9Y6Y8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SEC23IPQ9Y6Y8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC23IPQ9Y6Y8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC23IPQ9Y6Y8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC23IPQ9Y6Y8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC23IPQ9Y6Y8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC23IPQ9Y6Y8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC23IPQ9Y6Y8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC23IPQ9Y6Y8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC23IPQ9Y6Y8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC23IPQ9Y6Y8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC23IPQ9Y6Y8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC23IPQ9Y6Y8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC23IPQ9Y6Y8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC23IPQ9Y6Y8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC23IPQ9Y6Y8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC23IPQ9Y6Y8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC23IPQ9Y6Y8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC23IPQ9Y6Y8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC23IPQ9Y6Y8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC23IPQ9Y6Y8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC23IPQ9Y6Y8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC23IPQ9Y6Y8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC23IPQ9Y6Y8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23IPQ9Y6Y8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23IPQ9Y6Y8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEC23IPQ9Y6Y8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC23IPQ9Y6Y8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC23IPQ9Y6Y8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23IPQ9Y6Y8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23IPQ9Y6Y8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23IPQ9Y6Y8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC23IPQ9Y6Y8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC23IPQ9Y6Y8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC23IPQ9Y6Y8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC23IPQ9Y6Y8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC23IPQ9Y6Y8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEC23IPQ9Y6Y8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23IPQ9Y6Y8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23IPQ9Y6Y8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23IPQ9Y6Y8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC23IPQ9Y6Y8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC23IPQ9Y6Y8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEC23IPQ9Y6Y8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC23IPQ9Y6Y8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC23IPQ9Y6Y8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC23IPQ9Y6Y8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23IPQ9Y6Y8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23IPQ9Y6Y8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms