Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN7Q9Y6W3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN7Q9Y6W3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAPN7Q9Y6W3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN7Q9Y6W3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN7Q9Y6W3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN7Q9Y6W3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN7Q9Y6W3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN7Q9Y6W3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN7Q9Y6W3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN7Q9Y6W3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAPN7Q9Y6W3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAPN7Q9Y6W3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN7Q9Y6W3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN7Q9Y6W3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN7Q9Y6W3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAPN7Q9Y6W3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAPN7Q9Y6W3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN7Q9Y6W3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPN7Q9Y6W3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CAPN7Q9Y6W3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN7Q9Y6W3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN7Q9Y6W3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN7Q9Y6W3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN7Q9Y6W3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN7Q9Y6W3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN7Q9Y6W3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAPN7Q9Y6W3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN7Q9Y6W3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN7Q9Y6W3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN7Q9Y6W3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN7Q9Y6W3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN7Q9Y6W3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN7Q9Y6W3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN7Q9Y6W3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN7Q9Y6W3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN7Q9Y6W3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN7Q9Y6W3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN7Q9Y6W3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN7Q9Y6W3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN7Q9Y6W3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN7Q9Y6W3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN7Q9Y6W3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN7Q9Y6W3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN7Q9Y6W3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN7Q9Y6W3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN7Q9Y6W3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAPN7Q9Y6W3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN7Q9Y6W3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN7Q9Y6W3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN7Q9Y6W3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN7Q9Y6W3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN7Q9Y6W3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN7Q9Y6W3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN7Q9Y6W3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN7Q9Y6W3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN7Q9Y6W3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN7Q9Y6W3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN7Q9Y6W3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN7Q9Y6W3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN7Q9Y6W3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN7Q9Y6W3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN7Q9Y6W3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN7Q9Y6W3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN7Q9Y6W3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN7Q9Y6W3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN7Q9Y6W3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPN7Q9Y6W3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAPN7Q9Y6W3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN7Q9Y6W3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN7Q9Y6W3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN7Q9Y6W3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN7Q9Y6W3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN7Q9Y6W3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN7Q9Y6W3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN7Q9Y6W3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms