Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y657

SPIN1, Spindlin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN1Q9Y657 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIN1Q9Y657 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIN1Q9Y657 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPIN1Q9Y657 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIN1Q9Y657 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIN1Q9Y657 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIN1Q9Y657 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIN1Q9Y657 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPIN1Q9Y657 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPIN1Q9Y657 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPIN1Q9Y657 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPIN1Q9Y657 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIN1Q9Y657 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPIN1Q9Y657 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIN1Q9Y657 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIN1Q9Y657 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIN1Q9Y657 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPIN1Q9Y657 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPIN1Q9Y657 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIN1Q9Y657 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPIN1Q9Y657 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIN1Q9Y657 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPIN1Q9Y657 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIN1Q9Y657 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPIN1Q9Y657 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPIN1Q9Y657 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPIN1Q9Y657 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIN1Q9Y657 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPIN1Q9Y657 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIN1Q9Y657 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIN1Q9Y657 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPIN1Q9Y657 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIN1Q9Y657 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPIN1Q9Y657 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPIN1Q9Y657 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPIN1Q9Y657 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPIN1Q9Y657 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPIN1Q9Y657 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPIN1Q9Y657 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIN1Q9Y657 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPIN1Q9Y657 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPIN1Q9Y657 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIN1Q9Y657 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPIN1Q9Y657 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPIN1Q9Y657 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPIN1Q9Y657 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPIN1Q9Y657 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIN1Q9Y657 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIN1Q9Y657 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIN1Q9Y657 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIN1Q9Y657 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIN1Q9Y657 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIN1Q9Y657 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIN1Q9Y657 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIN1Q9Y657 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPIN1Q9Y657 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPIN1Q9Y657 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIN1Q9Y657 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIN1Q9Y657 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIN1Q9Y657 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIN1Q9Y657 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIN1Q9Y657 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIN1Q9Y657 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms