Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PCDHB2Q9Y5E7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PCDHB2Q9Y5E7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PCDHB2Q9Y5E7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PCDHB2Q9Y5E7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PCDHB2Q9Y5E7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PCDHB2Q9Y5E7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PCDHB2Q9Y5E7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PCDHB2Q9Y5E7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PCDHB2Q9Y5E7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PCDHB2Q9Y5E7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PCDHB2Q9Y5E7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PCDHB2Q9Y5E7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PCDHB2Q9Y5E7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PCDHB2Q9Y5E7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCDHB2Q9Y5E7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCDHB2Q9Y5E7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCDHB2Q9Y5E7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCDHB2Q9Y5E7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCDHB2Q9Y5E7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PCDHB2Q9Y5E7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PCDHB2Q9Y5E7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PCDHB2Q9Y5E7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCDHB2Q9Y5E7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCDHB2Q9Y5E7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PCDHB2Q9Y5E7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCDHB2Q9Y5E7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PCDHB2Q9Y5E7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCDHB2Q9Y5E7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCDHB2Q9Y5E7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PCDHB2Q9Y5E7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PCDHB2Q9Y5E7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCDHB2Q9Y5E7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCDHB2Q9Y5E7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PCDHB2Q9Y5E7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PCDHB2Q9Y5E7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PCDHB2Q9Y5E7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PCDHB2Q9Y5E7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PCDHB2Q9Y5E7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PCDHB2Q9Y5E7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PCDHB2Q9Y5E7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PCDHB2Q9Y5E7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PCDHB2Q9Y5E7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PCDHB2Q9Y5E7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PCDHB2Q9Y5E7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PCDHB2Q9Y5E7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PCDHB2Q9Y5E7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PCDHB2Q9Y5E7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PCDHB2Q9Y5E7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCDHB2Q9Y5E7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCDHB2Q9Y5E7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCDHB2Q9Y5E7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PCDHB2Q9Y5E7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCDHB2Q9Y5E7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PCDHB2Q9Y5E7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCDHB2Q9Y5E7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCDHB2Q9Y5E7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCDHB2Q9Y5E7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCDHB2Q9Y5E7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCDHB2Q9Y5E7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PCDHB2Q9Y5E7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCDHB2Q9Y5E7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PCDHB2Q9Y5E7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PCDHB2Q9Y5E7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PCDHB2Q9Y5E7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PCDHB2Q9Y5E7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PCDHB2Q9Y5E7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PCDHB2Q9Y5E7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PCDHB2Q9Y5E7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PCDHB2Q9Y5E7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PCDHB2Q9Y5E7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PCDHB2Q9Y5E7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PCDHB2Q9Y5E7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PCDHB2Q9Y5E7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PCDHB2Q9Y5E7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHB2Q9Y5E7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHB2Q9Y5E7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCDHB2Q9Y5E7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PCDHB2Q9Y5E7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCDHB2Q9Y5E7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PCDHB2Q9Y5E7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PCDHB2Q9Y5E7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PCDHB2Q9Y5E7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PCDHB2Q9Y5E7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCDHB2Q9Y5E7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PCDHB2Q9Y5E7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDHB2Q9Y5E7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDHB2Q9Y5E7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDHB2Q9Y5E7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDHB2Q9Y5E7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDHB2Q9Y5E7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDHB2Q9Y5E7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCDHB2Q9Y5E7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PCDHB2Q9Y5E7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDHB2Q9Y5E7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDHB2Q9Y5E7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PCDHB2Q9Y5E7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PCDHB2Q9Y5E7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms