Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDD3Q9Y3P4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDD3Q9Y3P4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDD3Q9Y3P4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDD3Q9Y3P4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDD3Q9Y3P4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDD3Q9Y3P4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDD3Q9Y3P4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDD3Q9Y3P4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDD3Q9Y3P4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDD3Q9Y3P4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDD3Q9Y3P4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDD3Q9Y3P4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDD3Q9Y3P4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDD3Q9Y3P4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDD3Q9Y3P4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDD3Q9Y3P4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDD3Q9Y3P4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDD3Q9Y3P4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDD3Q9Y3P4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDD3Q9Y3P4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDD3Q9Y3P4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDD3Q9Y3P4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDD3Q9Y3P4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDD3Q9Y3P4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDD3Q9Y3P4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDD3Q9Y3P4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDD3Q9Y3P4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDD3Q9Y3P4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDD3Q9Y3P4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHBDD3Q9Y3P4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDD3Q9Y3P4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDD3Q9Y3P4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDD3Q9Y3P4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDD3Q9Y3P4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDD3Q9Y3P4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDD3Q9Y3P4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDD3Q9Y3P4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDD3Q9Y3P4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RHBDD3Q9Y3P4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDD3Q9Y3P4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDD3Q9Y3P4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDD3Q9Y3P4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDD3Q9Y3P4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDD3Q9Y3P4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDD3Q9Y3P4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDD3Q9Y3P4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD3Q9Y3P4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHBDD3Q9Y3P4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RHBDD3Q9Y3P4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDD3Q9Y3P4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RHBDD3Q9Y3P4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms