Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRMD4BQ9Y2L6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRMD4BQ9Y2L6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRMD4BQ9Y2L6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRMD4BQ9Y2L6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRMD4BQ9Y2L6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRMD4BQ9Y2L6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMD4BQ9Y2L6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMD4BQ9Y2L6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRMD4BQ9Y2L6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRMD4BQ9Y2L6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FRMD4BQ9Y2L6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMD4BQ9Y2L6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FRMD4BQ9Y2L6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMD4BQ9Y2L6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FRMD4BQ9Y2L6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMD4BQ9Y2L6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FRMD4BQ9Y2L6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMD4BQ9Y2L6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FRMD4BQ9Y2L6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMD4BQ9Y2L6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FRMD4BQ9Y2L6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FRMD4BQ9Y2L6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FRMD4BQ9Y2L6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMD4BQ9Y2L6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FRMD4BQ9Y2L6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FRMD4BQ9Y2L6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FRMD4BQ9Y2L6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FRMD4BQ9Y2L6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FRMD4BQ9Y2L6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FRMD4BQ9Y2L6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FRMD4BQ9Y2L6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMD4BQ9Y2L6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FRMD4BQ9Y2L6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMD4BQ9Y2L6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FRMD4BQ9Y2L6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMD4BQ9Y2L6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FRMD4BQ9Y2L6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMD4BQ9Y2L6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMD4BQ9Y2L6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FRMD4BQ9Y2L6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FRMD4BQ9Y2L6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMD4BQ9Y2L6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FRMD4BQ9Y2L6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMD4BQ9Y2L6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMD4BQ9Y2L6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FRMD4BQ9Y2L6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMD4BQ9Y2L6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FRMD4BQ9Y2L6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMD4BQ9Y2L6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FRMD4BQ9Y2L6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FRMD4BQ9Y2L6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMD4BQ9Y2L6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FRMD4BQ9Y2L6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FRMD4BQ9Y2L6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FRMD4BQ9Y2L6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FRMD4BQ9Y2L6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FRMD4BQ9Y2L6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FRMD4BQ9Y2L6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FRMD4BQ9Y2L6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMD4BQ9Y2L6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FRMD4BQ9Y2L6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FRMD4BQ9Y2L6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMD4BQ9Y2L6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMD4BQ9Y2L6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMD4BQ9Y2L6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FRMD4BQ9Y2L6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRMD4BQ9Y2L6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FRMD4BQ9Y2L6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FRMD4BQ9Y2L6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FRMD4BQ9Y2L6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FRMD4BQ9Y2L6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FRMD4BQ9Y2L6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FRMD4BQ9Y2L6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMD4BQ9Y2L6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMD4BQ9Y2L6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMD4BQ9Y2L6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FRMD4BQ9Y2L6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FRMD4BQ9Y2L6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FRMD4BQ9Y2L6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FRMD4BQ9Y2L6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FRMD4BQ9Y2L6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMD4BQ9Y2L6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FRMD4BQ9Y2L6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms