Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIGD1AQ9Y241 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIGD1AQ9Y241 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIGD1AQ9Y241 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIGD1AQ9Y241 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIGD1AQ9Y241 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIGD1AQ9Y241 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIGD1AQ9Y241 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIGD1AQ9Y241 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIGD1AQ9Y241 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIGD1AQ9Y241 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIGD1AQ9Y241 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIGD1AQ9Y241 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIGD1AQ9Y241 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIGD1AQ9Y241 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIGD1AQ9Y241 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIGD1AQ9Y241 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIGD1AQ9Y241 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIGD1AQ9Y241 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIGD1AQ9Y241 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIGD1AQ9Y241 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIGD1AQ9Y241 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIGD1AQ9Y241 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIGD1AQ9Y241 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIGD1AQ9Y241 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIGD1AQ9Y241 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIGD1AQ9Y241 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIGD1AQ9Y241 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIGD1AQ9Y241 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIGD1AQ9Y241 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIGD1AQ9Y241 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIGD1AQ9Y241 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIGD1AQ9Y241 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIGD1AQ9Y241 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIGD1AQ9Y241 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIGD1AQ9Y241 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIGD1AQ9Y241 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIGD1AQ9Y241 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIGD1AQ9Y241 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HIGD1AQ9Y241 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIGD1AQ9Y241 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIGD1AQ9Y241 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HIGD1AQ9Y241 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HIGD1AQ9Y241 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIGD1AQ9Y241 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HIGD1AQ9Y241 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIGD1AQ9Y241 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIGD1AQ9Y241 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIGD1AQ9Y241 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIGD1AQ9Y241 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIGD1AQ9Y241 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIGD1AQ9Y241 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIGD1AQ9Y241 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIGD1AQ9Y241 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIGD1AQ9Y241 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIGD1AQ9Y241 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIGD1AQ9Y241 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HIGD1AQ9Y241 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIGD1AQ9Y241 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HIGD1AQ9Y241 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIGD1AQ9Y241 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms