Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHOC2Q9UQ13 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHOC2Q9UQ13 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHOC2Q9UQ13 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHOC2Q9UQ13 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SHOC2Q9UQ13 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHOC2Q9UQ13 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHOC2Q9UQ13 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHOC2Q9UQ13 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHOC2Q9UQ13 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHOC2Q9UQ13 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHOC2Q9UQ13 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHOC2Q9UQ13 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHOC2Q9UQ13 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHOC2Q9UQ13 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHOC2Q9UQ13 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHOC2Q9UQ13 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHOC2Q9UQ13 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHOC2Q9UQ13 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHOC2Q9UQ13 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHOC2Q9UQ13 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHOC2Q9UQ13 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHOC2Q9UQ13 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHOC2Q9UQ13 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHOC2Q9UQ13 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHOC2Q9UQ13 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHOC2Q9UQ13 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHOC2Q9UQ13 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHOC2Q9UQ13 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHOC2Q9UQ13 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHOC2Q9UQ13 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHOC2Q9UQ13 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHOC2Q9UQ13 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHOC2Q9UQ13 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHOC2Q9UQ13 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHOC2Q9UQ13 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SHOC2Q9UQ13 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHOC2Q9UQ13 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHOC2Q9UQ13 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHOC2Q9UQ13 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHOC2Q9UQ13 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHOC2Q9UQ13 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHOC2Q9UQ13 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHOC2Q9UQ13 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SHOC2Q9UQ13 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHOC2Q9UQ13 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHOC2Q9UQ13 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHOC2Q9UQ13 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHOC2Q9UQ13 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHOC2Q9UQ13 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHOC2Q9UQ13 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHOC2Q9UQ13 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHOC2Q9UQ13 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHOC2Q9UQ13 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHOC2Q9UQ13 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHOC2Q9UQ13 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHOC2Q9UQ13 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SHOC2Q9UQ13 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHOC2Q9UQ13 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SHOC2Q9UQ13 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SHOC2Q9UQ13 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SHOC2Q9UQ13 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHOC2Q9UQ13 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHOC2Q9UQ13 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SHOC2Q9UQ13 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SHOC2Q9UQ13 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHOC2Q9UQ13 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SHOC2Q9UQ13 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SHOC2Q9UQ13 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SHOC2Q9UQ13 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHOC2Q9UQ13 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHOC2Q9UQ13 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHOC2Q9UQ13 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHOC2Q9UQ13 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHOC2Q9UQ13 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHOC2Q9UQ13 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHOC2Q9UQ13 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHOC2Q9UQ13 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHOC2Q9UQ13 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHOC2Q9UQ13 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHOC2Q9UQ13 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHOC2Q9UQ13 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHOC2Q9UQ13 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHOC2Q9UQ13 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHOC2Q9UQ13 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHOC2Q9UQ13 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHOC2Q9UQ13 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHOC2Q9UQ13 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SHOC2Q9UQ13 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHOC2Q9UQ13 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHOC2Q9UQ13 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHOC2Q9UQ13 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHOC2Q9UQ13 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHOC2Q9UQ13 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHOC2Q9UQ13 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHOC2Q9UQ13 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHOC2Q9UQ13 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHOC2Q9UQ13 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SHOC2Q9UQ13 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
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