Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRC6BQ9UPQ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRC6BQ9UPQ9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNRC6BQ9UPQ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC6BQ9UPQ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNRC6BQ9UPQ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNRC6BQ9UPQ9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC6BQ9UPQ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRC6BQ9UPQ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRC6BQ9UPQ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC6BQ9UPQ9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRC6BQ9UPQ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6BQ9UPQ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRC6BQ9UPQ9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6BQ9UPQ9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6BQ9UPQ9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6BQ9UPQ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRC6BQ9UPQ9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRC6BQ9UPQ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6BQ9UPQ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6BQ9UPQ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRC6BQ9UPQ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRC6BQ9UPQ9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRC6BQ9UPQ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRC6BQ9UPQ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRC6BQ9UPQ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRC6BQ9UPQ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6BQ9UPQ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6BQ9UPQ9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6BQ9UPQ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6BQ9UPQ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6BQ9UPQ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6BQ9UPQ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRC6BQ9UPQ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRC6BQ9UPQ9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRC6BQ9UPQ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNRC6BQ9UPQ9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNRC6BQ9UPQ9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6BQ9UPQ9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6BQ9UPQ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6BQ9UPQ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRC6BQ9UPQ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6BQ9UPQ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRC6BQ9UPQ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TNRC6BQ9UPQ9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNRC6BQ9UPQ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNRC6BQ9UPQ9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNRC6BQ9UPQ9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNRC6BQ9UPQ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TNRC6BQ9UPQ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6BQ9UPQ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNRC6BQ9UPQ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6BQ9UPQ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRC6BQ9UPQ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRC6BQ9UPQ9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRC6BQ9UPQ9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRC6BQ9UPQ9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNRC6BQ9UPQ9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNRC6BQ9UPQ9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRC6BQ9UPQ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNRC6BQ9UPQ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNRC6BQ9UPQ9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRC6BQ9UPQ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRC6BQ9UPQ9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRC6BQ9UPQ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNRC6BQ9UPQ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRC6BQ9UPQ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRC6BQ9UPQ9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRC6BQ9UPQ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNRC6BQ9UPQ9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRC6BQ9UPQ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNRC6BQ9UPQ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRC6BQ9UPQ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNRC6BQ9UPQ9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNRC6BQ9UPQ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRC6BQ9UPQ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNRC6BQ9UPQ9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNRC6BQ9UPQ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNRC6BQ9UPQ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRC6BQ9UPQ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNRC6BQ9UPQ9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRC6BQ9UPQ9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNRC6BQ9UPQ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRC6BQ9UPQ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRC6BQ9UPQ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRC6BQ9UPQ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNRC6BQ9UPQ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNRC6BQ9UPQ9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNRC6BQ9UPQ9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms