Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDARQ9UNE0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDARQ9UNE0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EDARQ9UNE0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDARQ9UNE0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDARQ9UNE0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDARQ9UNE0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDARQ9UNE0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDARQ9UNE0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDARQ9UNE0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDARQ9UNE0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDARQ9UNE0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDARQ9UNE0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDARQ9UNE0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDARQ9UNE0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EDARQ9UNE0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDARQ9UNE0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDARQ9UNE0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDARQ9UNE0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDARQ9UNE0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDARQ9UNE0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDARQ9UNE0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDARQ9UNE0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDARQ9UNE0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDARQ9UNE0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDARQ9UNE0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDARQ9UNE0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDARQ9UNE0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDARQ9UNE0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDARQ9UNE0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDARQ9UNE0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDARQ9UNE0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EDARQ9UNE0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDARQ9UNE0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EDARQ9UNE0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDARQ9UNE0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EDARQ9UNE0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDARQ9UNE0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EDARQ9UNE0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDARQ9UNE0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EDARQ9UNE0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EDARQ9UNE0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EDARQ9UNE0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EDARQ9UNE0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EDARQ9UNE0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDARQ9UNE0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDARQ9UNE0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EDARQ9UNE0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EDARQ9UNE0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDARQ9UNE0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDARQ9UNE0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDARQ9UNE0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDARQ9UNE0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms