Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW7

ZNF229, Zinc finger protein 229, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF229Q9UJW7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF229Q9UJW7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF229Q9UJW7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF229Q9UJW7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF229Q9UJW7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF229Q9UJW7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF229Q9UJW7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF229Q9UJW7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF229Q9UJW7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF229Q9UJW7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF229Q9UJW7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF229Q9UJW7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF229Q9UJW7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF229Q9UJW7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF229Q9UJW7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF229Q9UJW7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF229Q9UJW7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF229Q9UJW7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF229Q9UJW7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF229Q9UJW7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF229Q9UJW7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF229Q9UJW7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF229Q9UJW7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF229Q9UJW7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF229Q9UJW7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF229Q9UJW7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF229Q9UJW7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF229Q9UJW7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF229Q9UJW7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF229Q9UJW7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF229Q9UJW7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF229Q9UJW7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF229Q9UJW7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF229Q9UJW7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF229Q9UJW7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF229Q9UJW7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF229Q9UJW7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF229Q9UJW7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF229Q9UJW7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF229Q9UJW7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF229Q9UJW7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF229Q9UJW7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF229Q9UJW7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF229Q9UJW7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF229Q9UJW7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF229Q9UJW7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF229Q9UJW7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF229Q9UJW7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF229Q9UJW7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF229Q9UJW7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF229Q9UJW7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF229Q9UJW7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms