Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBQLN2Q9UHD9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBQLN2Q9UHD9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBQLN2Q9UHD9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBQLN2Q9UHD9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBQLN2Q9UHD9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBQLN2Q9UHD9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBQLN2Q9UHD9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBQLN2Q9UHD9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBQLN2Q9UHD9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBQLN2Q9UHD9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBQLN2Q9UHD9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBQLN2Q9UHD9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBQLN2Q9UHD9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBQLN2Q9UHD9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBQLN2Q9UHD9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBQLN2Q9UHD9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBQLN2Q9UHD9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBQLN2Q9UHD9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBQLN2Q9UHD9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBQLN2Q9UHD9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBQLN2Q9UHD9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBQLN2Q9UHD9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBQLN2Q9UHD9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBQLN2Q9UHD9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBQLN2Q9UHD9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBQLN2Q9UHD9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBQLN2Q9UHD9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBQLN2Q9UHD9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBQLN2Q9UHD9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBQLN2Q9UHD9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBQLN2Q9UHD9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBQLN2Q9UHD9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBQLN2Q9UHD9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBQLN2Q9UHD9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBQLN2Q9UHD9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBQLN2Q9UHD9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBQLN2Q9UHD9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBQLN2Q9UHD9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBQLN2Q9UHD9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBQLN2Q9UHD9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBQLN2Q9UHD9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBQLN2Q9UHD9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBQLN2Q9UHD9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBQLN2Q9UHD9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBQLN2Q9UHD9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBQLN2Q9UHD9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBQLN2Q9UHD9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBQLN2Q9UHD9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBQLN2Q9UHD9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBQLN2Q9UHD9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBQLN2Q9UHD9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBQLN2Q9UHD9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBQLN2Q9UHD9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBQLN2Q9UHD9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBQLN2Q9UHD9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBQLN2Q9UHD9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBQLN2Q9UHD9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBQLN2Q9UHD9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBQLN2Q9UHD9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBQLN2Q9UHD9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBQLN2Q9UHD9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBQLN2Q9UHD9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBQLN2Q9UHD9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBQLN2Q9UHD9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBQLN2Q9UHD9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBQLN2Q9UHD9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBQLN2Q9UHD9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBQLN2Q9UHD9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms