Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNTNAP2Q9UHC6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CNTNAP2Q9UHC6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CNTNAP2Q9UHC6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CNTNAP2Q9UHC6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CNTNAP2Q9UHC6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNTNAP2Q9UHC6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CNTNAP2Q9UHC6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CNTNAP2Q9UHC6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CNTNAP2Q9UHC6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CNTNAP2Q9UHC6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CNTNAP2Q9UHC6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNTNAP2Q9UHC6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNTNAP2Q9UHC6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CNTNAP2Q9UHC6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNTNAP2Q9UHC6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNTNAP2Q9UHC6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNTNAP2Q9UHC6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNTNAP2Q9UHC6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTNAP2Q9UHC6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTNAP2Q9UHC6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CNTNAP2Q9UHC6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CNTNAP2Q9UHC6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CNTNAP2Q9UHC6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNTNAP2Q9UHC6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNTNAP2Q9UHC6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CNTNAP2Q9UHC6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNTNAP2Q9UHC6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CNTNAP2Q9UHC6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNTNAP2Q9UHC6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNTNAP2Q9UHC6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNTNAP2Q9UHC6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNTNAP2Q9UHC6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNTNAP2Q9UHC6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CNTNAP2Q9UHC6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP2Q9UHC6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNTNAP2Q9UHC6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNTNAP2Q9UHC6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNTNAP2Q9UHC6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CNTNAP2Q9UHC6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNTNAP2Q9UHC6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNTNAP2Q9UHC6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNTNAP2Q9UHC6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CNTNAP2Q9UHC6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNTNAP2Q9UHC6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNTNAP2Q9UHC6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNTNAP2Q9UHC6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNTNAP2Q9UHC6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNTNAP2Q9UHC6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNTNAP2Q9UHC6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNTNAP2Q9UHC6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNTNAP2Q9UHC6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CNTNAP2Q9UHC6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CNTNAP2Q9UHC6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNTNAP2Q9UHC6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNTNAP2Q9UHC6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNTNAP2Q9UHC6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNTNAP2Q9UHC6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNTNAP2Q9UHC6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNTNAP2Q9UHC6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNTNAP2Q9UHC6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNTNAP2Q9UHC6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CNTNAP2Q9UHC6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNTNAP2Q9UHC6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNTNAP2Q9UHC6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNTNAP2Q9UHC6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNTNAP2Q9UHC6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNTNAP2Q9UHC6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNTNAP2Q9UHC6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNTNAP2Q9UHC6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNTNAP2Q9UHC6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNTNAP2Q9UHC6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNTNAP2Q9UHC6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CNTNAP2Q9UHC6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNTNAP2Q9UHC6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNTNAP2Q9UHC6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNTNAP2Q9UHC6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTNAP2Q9UHC6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNTNAP2Q9UHC6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CNTNAP2Q9UHC6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CNTNAP2Q9UHC6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNTNAP2Q9UHC6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNTNAP2Q9UHC6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNTNAP2Q9UHC6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNTNAP2Q9UHC6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNTNAP2Q9UHC6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CNTNAP2Q9UHC6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CNTNAP2Q9UHC6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CNTNAP2Q9UHC6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CNTNAP2Q9UHC6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CNTNAP2Q9UHC6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms