Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
MLH3Q9UHC1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
MLH3Q9UHC1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
MLH3Q9UHC1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
MLH3Q9UHC1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
MLH3Q9UHC1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
MLH3Q9UHC1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
MLH3Q9UHC1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
MLH3Q9UHC1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
MLH3Q9UHC1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
MLH3Q9UHC1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
MLH3Q9UHC1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
MLH3Q9UHC1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
MLH3Q9UHC1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
MLH3Q9UHC1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
MLH3Q9UHC1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
MLH3Q9UHC1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
MLH3Q9UHC1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
MLH3Q9UHC1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
MLH3Q9UHC1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
MLH3Q9UHC1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
MLH3Q9UHC1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
MLH3Q9UHC1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
MLH3Q9UHC1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
MLH3Q9UHC1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
MLH3Q9UHC1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
MLH3Q9UHC1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
MLH3Q9UHC1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
MLH3Q9UHC1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
MLH3Q9UHC1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
MLH3Q9UHC1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
MLH3Q9UHC1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
MLH3Q9UHC1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
MLH3Q9UHC1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
MLH3Q9UHC1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
MLH3Q9UHC1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
MLH3Q9UHC1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
MLH3Q9UHC1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
MLH3Q9UHC1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
MLH3Q9UHC1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
MLH3Q9UHC1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
MLH3Q9UHC1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
MLH3Q9UHC1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
MLH3Q9UHC1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
MLH3Q9UHC1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
MLH3Q9UHC1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
MLH3Q9UHC1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
MLH3Q9UHC1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
MLH3Q9UHC1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
MLH3Q9UHC1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
MLH3Q9UHC1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
MLH3Q9UHC1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
MLH3Q9UHC1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
MLH3Q9UHC1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
MLH3Q9UHC1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
MLH3Q9UHC1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
MLH3Q9UHC1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
MLH3Q9UHC1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
MLH3Q9UHC1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
MLH3Q9UHC1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
MLH3Q9UHC1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
MLH3Q9UHC1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
MLH3Q9UHC1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
MLH3Q9UHC1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
MLH3Q9UHC1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
MLH3Q9UHC1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
MLH3Q9UHC1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
MLH3Q9UHC1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
MLH3Q9UHC1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
MLH3Q9UHC1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
MLH3Q9UHC1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
MLH3Q9UHC1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
MLH3Q9UHC1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
MLH3Q9UHC1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
MLH3Q9UHC1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
MLH3Q9UHC1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
MLH3Q9UHC1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
MLH3Q9UHC1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
MLH3Q9UHC1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
MLH3Q9UHC1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MLH3Q9UHC1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
MLH3Q9UHC1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
MLH3Q9UHC1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
MLH3Q9UHC1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
MLH3Q9UHC1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
MLH3Q9UHC1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
MLH3Q9UHC1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
MLH3Q9UHC1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
MLH3Q9UHC1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
MLH3Q9UHC1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
MLH3Q9UHC1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
MLH3Q9UHC1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.88■■■■■ 4.29
MLH3Q9UHC1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
MLH3Q9UHC1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
MLH3Q9UHC1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
MLH3Q9UHC1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
MLH3Q9UHC1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
MLH3Q9UHC1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
MLH3Q9UHC1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
MLH3Q9UHC1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2151.1 ms