Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL13Q9P2N7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL13Q9P2N7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL13Q9P2N7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL13Q9P2N7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL13Q9P2N7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL13Q9P2N7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL13Q9P2N7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL13Q9P2N7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL13Q9P2N7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL13Q9P2N7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL13Q9P2N7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL13Q9P2N7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL13Q9P2N7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL13Q9P2N7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL13Q9P2N7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL13Q9P2N7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL13Q9P2N7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL13Q9P2N7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL13Q9P2N7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL13Q9P2N7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL13Q9P2N7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL13Q9P2N7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL13Q9P2N7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL13Q9P2N7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL13Q9P2N7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL13Q9P2N7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL13Q9P2N7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL13Q9P2N7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL13Q9P2N7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL13Q9P2N7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL13Q9P2N7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL13Q9P2N7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL13Q9P2N7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL13Q9P2N7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL13Q9P2N7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL13Q9P2N7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL13Q9P2N7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL13Q9P2N7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL13Q9P2N7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL13Q9P2N7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL13Q9P2N7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL13Q9P2N7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL13Q9P2N7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL13Q9P2N7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL13Q9P2N7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL13Q9P2N7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL13Q9P2N7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL13Q9P2N7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL13Q9P2N7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL13Q9P2N7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL13Q9P2N7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL13Q9P2N7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL13Q9P2N7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL13Q9P2N7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL13Q9P2N7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL13Q9P2N7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL13Q9P2N7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL13Q9P2N7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL13Q9P2N7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms