Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
WDR35Q9P2L0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
WDR35Q9P2L0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
WDR35Q9P2L0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
WDR35Q9P2L0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
WDR35Q9P2L0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
WDR35Q9P2L0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
WDR35Q9P2L0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
WDR35Q9P2L0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
WDR35Q9P2L0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
WDR35Q9P2L0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
WDR35Q9P2L0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
WDR35Q9P2L0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR35Q9P2L0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
WDR35Q9P2L0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
WDR35Q9P2L0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
WDR35Q9P2L0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR35Q9P2L0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR35Q9P2L0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR35Q9P2L0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR35Q9P2L0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR35Q9P2L0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR35Q9P2L0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR35Q9P2L0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
WDR35Q9P2L0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
WDR35Q9P2L0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
WDR35Q9P2L0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
WDR35Q9P2L0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
WDR35Q9P2L0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
WDR35Q9P2L0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR35Q9P2L0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
WDR35Q9P2L0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
WDR35Q9P2L0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
WDR35Q9P2L0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
WDR35Q9P2L0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
WDR35Q9P2L0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
WDR35Q9P2L0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
WDR35Q9P2L0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR35Q9P2L0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR35Q9P2L0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR35Q9P2L0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR35Q9P2L0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR35Q9P2L0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR35Q9P2L0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
WDR35Q9P2L0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDR35Q9P2L0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
WDR35Q9P2L0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR35Q9P2L0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
WDR35Q9P2L0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
WDR35Q9P2L0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR35Q9P2L0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR35Q9P2L0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR35Q9P2L0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR35Q9P2L0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR35Q9P2L0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR35Q9P2L0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR35Q9P2L0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDR35Q9P2L0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
WDR35Q9P2L0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
WDR35Q9P2L0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDR35Q9P2L0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
WDR35Q9P2L0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
WDR35Q9P2L0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29■■■□□ 2.23
WDR35Q9P2L0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDR35Q9P2L0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDR35Q9P2L0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDR35Q9P2L0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
WDR35Q9P2L0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
WDR35Q9P2L0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
WDR35Q9P2L0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR35Q9P2L0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR35Q9P2L0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR35Q9P2L0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR35Q9P2L0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR35Q9P2L0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR35Q9P2L0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR35Q9P2L0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR35Q9P2L0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
WDR35Q9P2L0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
WDR35Q9P2L0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
WDR35Q9P2L0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WDR35Q9P2L0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WDR35Q9P2L0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WDR35Q9P2L0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
WDR35Q9P2L0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
WDR35Q9P2L0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WDR35Q9P2L0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
WDR35Q9P2L0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms