Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF2Q9P2I0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF2Q9P2I0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF2Q9P2I0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF2Q9P2I0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF2Q9P2I0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF2Q9P2I0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CPSF2Q9P2I0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF2Q9P2I0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF2Q9P2I0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CPSF2Q9P2I0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPSF2Q9P2I0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPSF2Q9P2I0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPSF2Q9P2I0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPSF2Q9P2I0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF2Q9P2I0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF2Q9P2I0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CPSF2Q9P2I0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CPSF2Q9P2I0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CPSF2Q9P2I0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPSF2Q9P2I0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF2Q9P2I0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF2Q9P2I0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CPSF2Q9P2I0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF2Q9P2I0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPSF2Q9P2I0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CPSF2Q9P2I0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF2Q9P2I0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPSF2Q9P2I0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CPSF2Q9P2I0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CPSF2Q9P2I0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CPSF2Q9P2I0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF2Q9P2I0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CPSF2Q9P2I0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF2Q9P2I0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPSF2Q9P2I0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF2Q9P2I0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF2Q9P2I0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF2Q9P2I0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CPSF2Q9P2I0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF2Q9P2I0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF2Q9P2I0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CPSF2Q9P2I0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CPSF2Q9P2I0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPSF2Q9P2I0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPSF2Q9P2I0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF2Q9P2I0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF2Q9P2I0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPSF2Q9P2I0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF2Q9P2I0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPSF2Q9P2I0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPSF2Q9P2I0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPSF2Q9P2I0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPSF2Q9P2I0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF2Q9P2I0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF2Q9P2I0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF2Q9P2I0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF2Q9P2I0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF2Q9P2I0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF2Q9P2I0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF2Q9P2I0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF2Q9P2I0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF2Q9P2I0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CPSF2Q9P2I0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF2Q9P2I0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF2Q9P2I0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF2Q9P2I0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF2Q9P2I0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF2Q9P2I0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF2Q9P2I0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF2Q9P2I0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF2Q9P2I0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF2Q9P2I0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF2Q9P2I0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms