Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSKIPQ9P0R6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSKIPQ9P0R6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSKIPQ9P0R6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSKIPQ9P0R6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSKIPQ9P0R6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSKIPQ9P0R6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSKIPQ9P0R6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSKIPQ9P0R6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSKIPQ9P0R6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSKIPQ9P0R6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSKIPQ9P0R6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSKIPQ9P0R6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSKIPQ9P0R6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSKIPQ9P0R6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GSKIPQ9P0R6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSKIPQ9P0R6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSKIPQ9P0R6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSKIPQ9P0R6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSKIPQ9P0R6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSKIPQ9P0R6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSKIPQ9P0R6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSKIPQ9P0R6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSKIPQ9P0R6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSKIPQ9P0R6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSKIPQ9P0R6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSKIPQ9P0R6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GSKIPQ9P0R6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSKIPQ9P0R6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSKIPQ9P0R6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSKIPQ9P0R6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSKIPQ9P0R6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSKIPQ9P0R6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSKIPQ9P0R6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSKIPQ9P0R6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSKIPQ9P0R6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSKIPQ9P0R6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSKIPQ9P0R6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSKIPQ9P0R6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSKIPQ9P0R6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSKIPQ9P0R6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSKIPQ9P0R6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSKIPQ9P0R6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSKIPQ9P0R6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSKIPQ9P0R6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSKIPQ9P0R6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSKIPQ9P0R6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSKIPQ9P0R6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSKIPQ9P0R6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSKIPQ9P0R6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSKIPQ9P0R6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GSKIPQ9P0R6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSKIPQ9P0R6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSKIPQ9P0R6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSKIPQ9P0R6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms