Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GSKIPQ9P0R6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GSKIPQ9P0R6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GSKIPQ9P0R6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSKIPQ9P0R6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSKIPQ9P0R6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSKIPQ9P0R6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSKIPQ9P0R6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSKIPQ9P0R6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GSKIPQ9P0R6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GSKIPQ9P0R6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSKIPQ9P0R6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSKIPQ9P0R6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GSKIPQ9P0R6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSKIPQ9P0R6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GSKIPQ9P0R6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSKIPQ9P0R6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GSKIPQ9P0R6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GSKIPQ9P0R6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GSKIPQ9P0R6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSKIPQ9P0R6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSKIPQ9P0R6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GSKIPQ9P0R6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSKIPQ9P0R6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSKIPQ9P0R6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSKIPQ9P0R6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSKIPQ9P0R6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GSKIPQ9P0R6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GSKIPQ9P0R6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GSKIPQ9P0R6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GSKIPQ9P0R6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSKIPQ9P0R6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSKIPQ9P0R6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSKIPQ9P0R6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSKIPQ9P0R6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSKIPQ9P0R6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSKIPQ9P0R6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSKIPQ9P0R6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSKIPQ9P0R6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSKIPQ9P0R6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSKIPQ9P0R6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSKIPQ9P0R6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSKIPQ9P0R6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSKIPQ9P0R6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSKIPQ9P0R6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSKIPQ9P0R6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSKIPQ9P0R6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSKIPQ9P0R6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSKIPQ9P0R6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSKIPQ9P0R6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSKIPQ9P0R6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSKIPQ9P0R6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSKIPQ9P0R6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSKIPQ9P0R6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSKIPQ9P0R6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSKIPQ9P0R6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSKIPQ9P0R6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSKIPQ9P0R6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSKIPQ9P0R6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSKIPQ9P0R6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSKIPQ9P0R6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSKIPQ9P0R6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSKIPQ9P0R6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSKIPQ9P0R6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSKIPQ9P0R6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSKIPQ9P0R6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSKIPQ9P0R6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSKIPQ9P0R6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSKIPQ9P0R6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSKIPQ9P0R6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSKIPQ9P0R6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSKIPQ9P0R6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSKIPQ9P0R6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSKIPQ9P0R6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSKIPQ9P0R6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSKIPQ9P0R6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSKIPQ9P0R6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSKIPQ9P0R6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSKIPQ9P0R6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSKIPQ9P0R6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSKIPQ9P0R6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSKIPQ9P0R6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSKIPQ9P0R6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSKIPQ9P0R6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSKIPQ9P0R6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSKIPQ9P0R6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSKIPQ9P0R6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GSKIPQ9P0R6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSKIPQ9P0R6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSKIPQ9P0R6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSKIPQ9P0R6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSKIPQ9P0R6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSKIPQ9P0R6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSKIPQ9P0R6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSKIPQ9P0R6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GSKIPQ9P0R6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSKIPQ9P0R6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSKIPQ9P0R6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSKIPQ9P0R6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSKIPQ9P0R6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms