Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKIRAS1Q9NYS0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NKIRAS1Q9NYS0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NKIRAS1Q9NYS0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NKIRAS1Q9NYS0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKIRAS1Q9NYS0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKIRAS1Q9NYS0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKIRAS1Q9NYS0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKIRAS1Q9NYS0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKIRAS1Q9NYS0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKIRAS1Q9NYS0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKIRAS1Q9NYS0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKIRAS1Q9NYS0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKIRAS1Q9NYS0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKIRAS1Q9NYS0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKIRAS1Q9NYS0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKIRAS1Q9NYS0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NKIRAS1Q9NYS0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKIRAS1Q9NYS0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKIRAS1Q9NYS0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKIRAS1Q9NYS0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKIRAS1Q9NYS0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKIRAS1Q9NYS0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKIRAS1Q9NYS0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKIRAS1Q9NYS0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NKIRAS1Q9NYS0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NKIRAS1Q9NYS0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NKIRAS1Q9NYS0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NKIRAS1Q9NYS0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKIRAS1Q9NYS0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKIRAS1Q9NYS0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NKIRAS1Q9NYS0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NKIRAS1Q9NYS0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NKIRAS1Q9NYS0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKIRAS1Q9NYS0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NKIRAS1Q9NYS0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NKIRAS1Q9NYS0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NKIRAS1Q9NYS0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NKIRAS1Q9NYS0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NKIRAS1Q9NYS0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NKIRAS1Q9NYS0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NKIRAS1Q9NYS0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKIRAS1Q9NYS0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKIRAS1Q9NYS0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NKIRAS1Q9NYS0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NKIRAS1Q9NYS0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKIRAS1Q9NYS0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NKIRAS1Q9NYS0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NKIRAS1Q9NYS0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKIRAS1Q9NYS0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NKIRAS1Q9NYS0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NKIRAS1Q9NYS0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NKIRAS1Q9NYS0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKIRAS1Q9NYS0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NKIRAS1Q9NYS0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NKIRAS1Q9NYS0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NKIRAS1Q9NYS0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NKIRAS1Q9NYS0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms