Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL39Q9NYK5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MRPL39Q9NYK5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL39Q9NYK5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MRPL39Q9NYK5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL39Q9NYK5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL39Q9NYK5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MRPL39Q9NYK5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MRPL39Q9NYK5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL39Q9NYK5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL39Q9NYK5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL39Q9NYK5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL39Q9NYK5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL39Q9NYK5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL39Q9NYK5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL39Q9NYK5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL39Q9NYK5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL39Q9NYK5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL39Q9NYK5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL39Q9NYK5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL39Q9NYK5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL39Q9NYK5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL39Q9NYK5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL39Q9NYK5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL39Q9NYK5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL39Q9NYK5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL39Q9NYK5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL39Q9NYK5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL39Q9NYK5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL39Q9NYK5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL39Q9NYK5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL39Q9NYK5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms