Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNK4Q9NYG8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNK4Q9NYG8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNK4Q9NYG8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNK4Q9NYG8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNK4Q9NYG8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNK4Q9NYG8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNK4Q9NYG8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNK4Q9NYG8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNK4Q9NYG8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNK4Q9NYG8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNK4Q9NYG8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNK4Q9NYG8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNK4Q9NYG8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNK4Q9NYG8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNK4Q9NYG8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNK4Q9NYG8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNK4Q9NYG8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNK4Q9NYG8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNK4Q9NYG8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNK4Q9NYG8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNK4Q9NYG8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNK4Q9NYG8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNK4Q9NYG8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNK4Q9NYG8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNK4Q9NYG8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNK4Q9NYG8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNK4Q9NYG8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNK4Q9NYG8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNK4Q9NYG8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNK4Q9NYG8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNK4Q9NYG8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNK4Q9NYG8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNK4Q9NYG8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNK4Q9NYG8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNK4Q9NYG8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNK4Q9NYG8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNK4Q9NYG8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNK4Q9NYG8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNK4Q9NYG8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNK4Q9NYG8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNK4Q9NYG8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNK4Q9NYG8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNK4Q9NYG8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNK4Q9NYG8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNK4Q9NYG8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNK4Q9NYG8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNK4Q9NYG8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNK4Q9NYG8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNK4Q9NYG8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNK4Q9NYG8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNK4Q9NYG8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNK4Q9NYG8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNK4Q9NYG8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNK4Q9NYG8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNK4Q9NYG8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNK4Q9NYG8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNK4Q9NYG8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNK4Q9NYG8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNK4Q9NYG8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNK4Q9NYG8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNK4Q9NYG8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNK4Q9NYG8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNK4Q9NYG8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNK4Q9NYG8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNK4Q9NYG8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNK4Q9NYG8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNK4Q9NYG8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK4Q9NYG8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNK4Q9NYG8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNK4Q9NYG8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNK4Q9NYG8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNK4Q9NYG8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNK4Q9NYG8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNK4Q9NYG8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNK4Q9NYG8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNK4Q9NYG8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK4Q9NYG8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK4Q9NYG8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNK4Q9NYG8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNK4Q9NYG8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNK4Q9NYG8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNK4Q9NYG8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNK4Q9NYG8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNK4Q9NYG8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNK4Q9NYG8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms