Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALKBH4Q9NXW9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKBH4Q9NXW9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALKBH4Q9NXW9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKBH4Q9NXW9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKBH4Q9NXW9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALKBH4Q9NXW9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALKBH4Q9NXW9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALKBH4Q9NXW9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKBH4Q9NXW9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALKBH4Q9NXW9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALKBH4Q9NXW9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALKBH4Q9NXW9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALKBH4Q9NXW9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKBH4Q9NXW9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKBH4Q9NXW9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALKBH4Q9NXW9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKBH4Q9NXW9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALKBH4Q9NXW9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ALKBH4Q9NXW9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALKBH4Q9NXW9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKBH4Q9NXW9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKBH4Q9NXW9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKBH4Q9NXW9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKBH4Q9NXW9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALKBH4Q9NXW9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALKBH4Q9NXW9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALKBH4Q9NXW9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALKBH4Q9NXW9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALKBH4Q9NXW9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALKBH4Q9NXW9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALKBH4Q9NXW9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALKBH4Q9NXW9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALKBH4Q9NXW9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALKBH4Q9NXW9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALKBH4Q9NXW9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALKBH4Q9NXW9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALKBH4Q9NXW9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALKBH4Q9NXW9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ALKBH4Q9NXW9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALKBH4Q9NXW9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKBH4Q9NXW9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALKBH4Q9NXW9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALKBH4Q9NXW9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALKBH4Q9NXW9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALKBH4Q9NXW9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKBH4Q9NXW9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKBH4Q9NXW9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKBH4Q9NXW9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKBH4Q9NXW9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKBH4Q9NXW9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKBH4Q9NXW9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALKBH4Q9NXW9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALKBH4Q9NXW9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKBH4Q9NXW9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKBH4Q9NXW9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALKBH4Q9NXW9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKBH4Q9NXW9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKBH4Q9NXW9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALKBH4Q9NXW9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKBH4Q9NXW9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALKBH4Q9NXW9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALKBH4Q9NXW9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKBH4Q9NXW9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALKBH4Q9NXW9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALKBH4Q9NXW9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALKBH4Q9NXW9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALKBH4Q9NXW9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALKBH4Q9NXW9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALKBH4Q9NXW9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALKBH4Q9NXW9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALKBH4Q9NXW9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms