Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
COMMD8Q9NX08 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COMMD8Q9NX08 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COMMD8Q9NX08 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COMMD8Q9NX08 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
COMMD8Q9NX08 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COMMD8Q9NX08 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COMMD8Q9NX08 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COMMD8Q9NX08 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COMMD8Q9NX08 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COMMD8Q9NX08 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COMMD8Q9NX08 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COMMD8Q9NX08 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COMMD8Q9NX08 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COMMD8Q9NX08 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COMMD8Q9NX08 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COMMD8Q9NX08 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COMMD8Q9NX08 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COMMD8Q9NX08 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COMMD8Q9NX08 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COMMD8Q9NX08 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COMMD8Q9NX08 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COMMD8Q9NX08 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COMMD8Q9NX08 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COMMD8Q9NX08 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COMMD8Q9NX08 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COMMD8Q9NX08 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COMMD8Q9NX08 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
COMMD8Q9NX08 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COMMD8Q9NX08 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COMMD8Q9NX08 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COMMD8Q9NX08 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COMMD8Q9NX08 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COMMD8Q9NX08 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COMMD8Q9NX08 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COMMD8Q9NX08 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COMMD8Q9NX08 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COMMD8Q9NX08 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COMMD8Q9NX08 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COMMD8Q9NX08 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COMMD8Q9NX08 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COMMD8Q9NX08 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COMMD8Q9NX08 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COMMD8Q9NX08 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COMMD8Q9NX08 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COMMD8Q9NX08 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COMMD8Q9NX08 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COMMD8Q9NX08 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COMMD8Q9NX08 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COMMD8Q9NX08 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COMMD8Q9NX08 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COMMD8Q9NX08 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COMMD8Q9NX08 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COMMD8Q9NX08 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
COMMD8Q9NX08 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COMMD8Q9NX08 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COMMD8Q9NX08 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COMMD8Q9NX08 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COMMD8Q9NX08 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COMMD8Q9NX08 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COMMD8Q9NX08 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COMMD8Q9NX08 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COMMD8Q9NX08 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COMMD8Q9NX08 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COMMD8Q9NX08 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COMMD8Q9NX08 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COMMD8Q9NX08 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COMMD8Q9NX08 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COMMD8Q9NX08 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COMMD8Q9NX08 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COMMD8Q9NX08 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COMMD8Q9NX08 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COMMD8Q9NX08 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COMMD8Q9NX08 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COMMD8Q9NX08 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COMMD8Q9NX08 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COMMD8Q9NX08 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COMMD8Q9NX08 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
COMMD8Q9NX08 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
COMMD8Q9NX08 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COMMD8Q9NX08 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COMMD8Q9NX08 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
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