Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FANCLQ9NW38 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FANCLQ9NW38 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FANCLQ9NW38 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FANCLQ9NW38 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FANCLQ9NW38 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FANCLQ9NW38 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FANCLQ9NW38 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FANCLQ9NW38 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCLQ9NW38 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCLQ9NW38 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FANCLQ9NW38 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FANCLQ9NW38 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCLQ9NW38 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCLQ9NW38 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCLQ9NW38 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FANCLQ9NW38 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FANCLQ9NW38 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FANCLQ9NW38 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FANCLQ9NW38 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FANCLQ9NW38 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FANCLQ9NW38 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FANCLQ9NW38 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FANCLQ9NW38 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FANCLQ9NW38 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FANCLQ9NW38 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FANCLQ9NW38 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FANCLQ9NW38 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FANCLQ9NW38 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FANCLQ9NW38 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
FANCLQ9NW38 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FANCLQ9NW38 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FANCLQ9NW38 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FANCLQ9NW38 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
FANCLQ9NW38 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FANCLQ9NW38 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FANCLQ9NW38 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FANCLQ9NW38 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FANCLQ9NW38 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FANCLQ9NW38 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FANCLQ9NW38 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FANCLQ9NW38 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FANCLQ9NW38 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FANCLQ9NW38 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FANCLQ9NW38 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FANCLQ9NW38 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FANCLQ9NW38 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FANCLQ9NW38 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FANCLQ9NW38 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FANCLQ9NW38 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FANCLQ9NW38 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FANCLQ9NW38 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
FANCLQ9NW38 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FANCLQ9NW38 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FANCLQ9NW38 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FANCLQ9NW38 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FANCLQ9NW38 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FANCLQ9NW38 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FANCLQ9NW38 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FANCLQ9NW38 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FANCLQ9NW38 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCLQ9NW38 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCLQ9NW38 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FANCLQ9NW38 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FANCLQ9NW38 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FANCLQ9NW38 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FANCLQ9NW38 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FANCLQ9NW38 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FANCLQ9NW38 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FANCLQ9NW38 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FANCLQ9NW38 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FANCLQ9NW38 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FANCLQ9NW38 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FANCLQ9NW38 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FANCLQ9NW38 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FANCLQ9NW38 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FANCLQ9NW38 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
FANCLQ9NW38 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FANCLQ9NW38 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FANCLQ9NW38 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FANCLQ9NW38 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FANCLQ9NW38 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FANCLQ9NW38 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FANCLQ9NW38 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FANCLQ9NW38 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FANCLQ9NW38 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FANCLQ9NW38 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FANCLQ9NW38 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FANCLQ9NW38 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FANCLQ9NW38 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FANCLQ9NW38 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FANCLQ9NW38 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FANCLQ9NW38 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FANCLQ9NW38 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FANCLQ9NW38 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FANCLQ9NW38 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FANCLQ9NW38 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FANCLQ9NW38 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FANCLQ9NW38 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FANCLQ9NW38 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms