Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KLHL11Q9NVR0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KLHL11Q9NVR0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL11Q9NVR0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KLHL11Q9NVR0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KLHL11Q9NVR0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KLHL11Q9NVR0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHL11Q9NVR0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KLHL11Q9NVR0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHL11Q9NVR0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KLHL11Q9NVR0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHL11Q9NVR0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHL11Q9NVR0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHL11Q9NVR0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHL11Q9NVR0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHL11Q9NVR0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHL11Q9NVR0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLHL11Q9NVR0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KLHL11Q9NVR0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHL11Q9NVR0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KLHL11Q9NVR0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHL11Q9NVR0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KLHL11Q9NVR0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHL11Q9NVR0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KLHL11Q9NVR0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KLHL11Q9NVR0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KLHL11Q9NVR0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHL11Q9NVR0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHL11Q9NVR0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHL11Q9NVR0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KLHL11Q9NVR0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KLHL11Q9NVR0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KLHL11Q9NVR0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KLHL11Q9NVR0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL11Q9NVR0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KLHL11Q9NVR0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KLHL11Q9NVR0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KLHL11Q9NVR0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KLHL11Q9NVR0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KLHL11Q9NVR0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KLHL11Q9NVR0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KLHL11Q9NVR0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KLHL11Q9NVR0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KLHL11Q9NVR0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KLHL11Q9NVR0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHL11Q9NVR0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHL11Q9NVR0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHL11Q9NVR0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHL11Q9NVR0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHL11Q9NVR0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHL11Q9NVR0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHL11Q9NVR0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHL11Q9NVR0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KLHL11Q9NVR0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KLHL11Q9NVR0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHL11Q9NVR0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHL11Q9NVR0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHL11Q9NVR0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHL11Q9NVR0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHL11Q9NVR0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHL11Q9NVR0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHL11Q9NVR0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHL11Q9NVR0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms