Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RRP7BPQ9NSQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RRP7BPQ9NSQ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RRP7BPQ9NSQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
RRP7BPQ9NSQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
RRP7BPQ9NSQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
RRP7BPQ9NSQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
RRP7BPQ9NSQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RRP7BPQ9NSQ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
RRP7BPQ9NSQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
RRP7BPQ9NSQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
RRP7BPQ9NSQ0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
RRP7BPQ9NSQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
RRP7BPQ9NSQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
RRP7BPQ9NSQ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
RRP7BPQ9NSQ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
RRP7BPQ9NSQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
RRP7BPQ9NSQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
RRP7BPQ9NSQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
RRP7BPQ9NSQ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
RRP7BPQ9NSQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
RRP7BPQ9NSQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
RRP7BPQ9NSQ0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
RRP7BPQ9NSQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
RRP7BPQ9NSQ0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
RRP7BPQ9NSQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
RRP7BPQ9NSQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
RRP7BPQ9NSQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
RRP7BPQ9NSQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
RRP7BPQ9NSQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
RRP7BPQ9NSQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
RRP7BPQ9NSQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
RRP7BPQ9NSQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RRP7BPQ9NSQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RRP7BPQ9NSQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
RRP7BPQ9NSQ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
RRP7BPQ9NSQ0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
RRP7BPQ9NSQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RRP7BPQ9NSQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RRP7BPQ9NSQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RRP7BPQ9NSQ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RRP7BPQ9NSQ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RRP7BPQ9NSQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
RRP7BPQ9NSQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
RRP7BPQ9NSQ0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
RRP7BPQ9NSQ0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RRP7BPQ9NSQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
RRP7BPQ9NSQ0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
RRP7BPQ9NSQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RRP7BPQ9NSQ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
RRP7BPQ9NSQ0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
RRP7BPQ9NSQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
RRP7BPQ9NSQ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RRP7BPQ9NSQ0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
RRP7BPQ9NSQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
RRP7BPQ9NSQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
RRP7BPQ9NSQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
RRP7BPQ9NSQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
RRP7BPQ9NSQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
RRP7BPQ9NSQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
RRP7BPQ9NSQ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.57■■■■■ 4.24
RRP7BPQ9NSQ0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
RRP7BPQ9NSQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.56■■■■■ 4.24
RRP7BPQ9NSQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
RRP7BPQ9NSQ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
RRP7BPQ9NSQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
RRP7BPQ9NSQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
RRP7BPQ9NSQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
RRP7BPQ9NSQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
RRP7BPQ9NSQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
RRP7BPQ9NSQ0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
RRP7BPQ9NSQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
RRP7BPQ9NSQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
RRP7BPQ9NSQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
RRP7BPQ9NSQ0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
RRP7BPQ9NSQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
RRP7BPQ9NSQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
RRP7BPQ9NSQ0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
RRP7BPQ9NSQ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
RRP7BPQ9NSQ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
RRP7BPQ9NSQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
RRP7BPQ9NSQ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
RRP7BPQ9NSQ0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
RRP7BPQ9NSQ0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
RRP7BPQ9NSQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms