Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VCX3AQ9NNX9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCX3AQ9NNX9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VCX3AQ9NNX9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCX3AQ9NNX9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCX3AQ9NNX9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCX3AQ9NNX9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCX3AQ9NNX9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCX3AQ9NNX9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCX3AQ9NNX9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCX3AQ9NNX9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCX3AQ9NNX9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VCX3AQ9NNX9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCX3AQ9NNX9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCX3AQ9NNX9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCX3AQ9NNX9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCX3AQ9NNX9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCX3AQ9NNX9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VCX3AQ9NNX9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCX3AQ9NNX9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCX3AQ9NNX9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCX3AQ9NNX9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCX3AQ9NNX9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCX3AQ9NNX9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCX3AQ9NNX9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCX3AQ9NNX9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCX3AQ9NNX9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCX3AQ9NNX9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCX3AQ9NNX9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCX3AQ9NNX9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCX3AQ9NNX9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCX3AQ9NNX9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCX3AQ9NNX9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCX3AQ9NNX9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCX3AQ9NNX9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCX3AQ9NNX9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCX3AQ9NNX9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VCX3AQ9NNX9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VCX3AQ9NNX9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCX3AQ9NNX9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VCX3AQ9NNX9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCX3AQ9NNX9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VCX3AQ9NNX9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCX3AQ9NNX9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VCX3AQ9NNX9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VCX3AQ9NNX9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VCX3AQ9NNX9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCX3AQ9NNX9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCX3AQ9NNX9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VCX3AQ9NNX9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCX3AQ9NNX9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VCX3AQ9NNX9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCX3AQ9NNX9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCX3AQ9NNX9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VCX3AQ9NNX9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VCX3AQ9NNX9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VCX3AQ9NNX9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VCX3AQ9NNX9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VCX3AQ9NNX9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCX3AQ9NNX9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCX3AQ9NNX9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCX3AQ9NNX9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCX3AQ9NNX9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VCX3AQ9NNX9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VCX3AQ9NNX9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VCX3AQ9NNX9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VCX3AQ9NNX9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCX3AQ9NNX9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VCX3AQ9NNX9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCX3AQ9NNX9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCX3AQ9NNX9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCX3AQ9NNX9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCX3AQ9NNX9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCX3AQ9NNX9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCX3AQ9NNX9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCX3AQ9NNX9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCX3AQ9NNX9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCX3AQ9NNX9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCX3AQ9NNX9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCX3AQ9NNX9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCX3AQ9NNX9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCX3AQ9NNX9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCX3AQ9NNX9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCX3AQ9NNX9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCX3AQ9NNX9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCX3AQ9NNX9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCX3AQ9NNX9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCX3AQ9NNX9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms