Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC4CQ9HCJ2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC4CQ9HCJ2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4CQ9HCJ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4CQ9HCJ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC4CQ9HCJ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC4CQ9HCJ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC4CQ9HCJ2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC4CQ9HCJ2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC4CQ9HCJ2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC4CQ9HCJ2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC4CQ9HCJ2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC4CQ9HCJ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC4CQ9HCJ2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC4CQ9HCJ2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC4CQ9HCJ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC4CQ9HCJ2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC4CQ9HCJ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC4CQ9HCJ2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC4CQ9HCJ2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC4CQ9HCJ2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC4CQ9HCJ2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC4CQ9HCJ2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC4CQ9HCJ2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC4CQ9HCJ2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC4CQ9HCJ2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC4CQ9HCJ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC4CQ9HCJ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC4CQ9HCJ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC4CQ9HCJ2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC4CQ9HCJ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC4CQ9HCJ2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC4CQ9HCJ2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC4CQ9HCJ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC4CQ9HCJ2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4CQ9HCJ2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4CQ9HCJ2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC4CQ9HCJ2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC4CQ9HCJ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC4CQ9HCJ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC4CQ9HCJ2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC4CQ9HCJ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4CQ9HCJ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4CQ9HCJ2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4CQ9HCJ2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC4CQ9HCJ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC4CQ9HCJ2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC4CQ9HCJ2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC4CQ9HCJ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC4CQ9HCJ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC4CQ9HCJ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC4CQ9HCJ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC4CQ9HCJ2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC4CQ9HCJ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC4CQ9HCJ2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC4CQ9HCJ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC4CQ9HCJ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC4CQ9HCJ2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC4CQ9HCJ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LRRC4CQ9HCJ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC4CQ9HCJ2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC4CQ9HCJ2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC4CQ9HCJ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC4CQ9HCJ2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC4CQ9HCJ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC4CQ9HCJ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC4CQ9HCJ2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC4CQ9HCJ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC4CQ9HCJ2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms