Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SCAF1Q9H7N4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SCAF1Q9H7N4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SCAF1Q9H7N4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SCAF1Q9H7N4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SCAF1Q9H7N4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SCAF1Q9H7N4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
SCAF1Q9H7N4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
SCAF1Q9H7N4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SCAF1Q9H7N4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
SCAF1Q9H7N4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SCAF1Q9H7N4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SCAF1Q9H7N4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SCAF1Q9H7N4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
SCAF1Q9H7N4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
SCAF1Q9H7N4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.17
SCAF1Q9H7N4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SCAF1Q9H7N4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
SCAF1Q9H7N4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
SCAF1Q9H7N4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
SCAF1Q9H7N4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
SCAF1Q9H7N4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SCAF1Q9H7N4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.15
SCAF1Q9H7N4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
SCAF1Q9H7N4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SCAF1Q9H7N4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SCAF1Q9H7N4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SCAF1Q9H7N4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SCAF1Q9H7N4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SCAF1Q9H7N4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
SCAF1Q9H7N4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SCAF1Q9H7N4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SCAF1Q9H7N4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SCAF1Q9H7N4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SCAF1Q9H7N4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SCAF1Q9H7N4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
SCAF1Q9H7N4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SCAF1Q9H7N4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SCAF1Q9H7N4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SCAF1Q9H7N4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SCAF1Q9H7N4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SCAF1Q9H7N4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SCAF1Q9H7N4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SCAF1Q9H7N4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SCAF1Q9H7N4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SCAF1Q9H7N4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SCAF1Q9H7N4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SCAF1Q9H7N4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SCAF1Q9H7N4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SCAF1Q9H7N4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SCAF1Q9H7N4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SCAF1Q9H7N4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SCAF1Q9H7N4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SCAF1Q9H7N4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SCAF1Q9H7N4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
SCAF1Q9H7N4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
SCAF1Q9H7N4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
SCAF1Q9H7N4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SCAF1Q9H7N4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SCAF1Q9H7N4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SCAF1Q9H7N4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SCAF1Q9H7N4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
SCAF1Q9H7N4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
SCAF1Q9H7N4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SCAF1Q9H7N4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SCAF1Q9H7N4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SCAF1Q9H7N4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
SCAF1Q9H7N4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SCAF1Q9H7N4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
SCAF1Q9H7N4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SCAF1Q9H7N4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SCAF1Q9H7N4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SCAF1Q9H7N4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SCAF1Q9H7N4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
SCAF1Q9H7N4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SCAF1Q9H7N4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SCAF1Q9H7N4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SCAF1Q9H7N4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SCAF1Q9H7N4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SCAF1Q9H7N4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SCAF1Q9H7N4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SCAF1Q9H7N4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SCAF1Q9H7N4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SCAF1Q9H7N4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SCAF1Q9H7N4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SCAF1Q9H7N4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms