Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIF1Q9H611 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIF1Q9H611 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIF1Q9H611 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIF1Q9H611 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIF1Q9H611 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIF1Q9H611 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIF1Q9H611 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIF1Q9H611 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIF1Q9H611 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIF1Q9H611 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIF1Q9H611 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIF1Q9H611 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIF1Q9H611 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIF1Q9H611 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PIF1Q9H611 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIF1Q9H611 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIF1Q9H611 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIF1Q9H611 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIF1Q9H611 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIF1Q9H611 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIF1Q9H611 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIF1Q9H611 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIF1Q9H611 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIF1Q9H611 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIF1Q9H611 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIF1Q9H611 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIF1Q9H611 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIF1Q9H611 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIF1Q9H611 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIF1Q9H611 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIF1Q9H611 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIF1Q9H611 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIF1Q9H611 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIF1Q9H611 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIF1Q9H611 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PIF1Q9H611 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIF1Q9H611 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PIF1Q9H611 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIF1Q9H611 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIF1Q9H611 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIF1Q9H611 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIF1Q9H611 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIF1Q9H611 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIF1Q9H611 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIF1Q9H611 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIF1Q9H611 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIF1Q9H611 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIF1Q9H611 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIF1Q9H611 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIF1Q9H611 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIF1Q9H611 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PIF1Q9H611 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIF1Q9H611 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIF1Q9H611 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIF1Q9H611 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIF1Q9H611 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIF1Q9H611 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIF1Q9H611 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIF1Q9H611 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIF1Q9H611 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIF1Q9H611 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIF1Q9H611 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIF1Q9H611 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIF1Q9H611 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIF1Q9H611 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PIF1Q9H611 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIF1Q9H611 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIF1Q9H611 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIF1Q9H611 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIF1Q9H611 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIF1Q9H611 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIF1Q9H611 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIF1Q9H611 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms