Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4X1

RGCC, Regulator of cell cycle RGCC, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGCCQ9H4X1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGCCQ9H4X1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RGCCQ9H4X1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RGCCQ9H4X1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RGCCQ9H4X1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RGCCQ9H4X1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGCCQ9H4X1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RGCCQ9H4X1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RGCCQ9H4X1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGCCQ9H4X1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGCCQ9H4X1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RGCCQ9H4X1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGCCQ9H4X1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGCCQ9H4X1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGCCQ9H4X1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGCCQ9H4X1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGCCQ9H4X1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGCCQ9H4X1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGCCQ9H4X1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGCCQ9H4X1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGCCQ9H4X1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGCCQ9H4X1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGCCQ9H4X1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGCCQ9H4X1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RGCCQ9H4X1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RGCCQ9H4X1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RGCCQ9H4X1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGCCQ9H4X1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RGCCQ9H4X1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RGCCQ9H4X1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RGCCQ9H4X1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGCCQ9H4X1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RGCCQ9H4X1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGCCQ9H4X1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGCCQ9H4X1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGCCQ9H4X1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGCCQ9H4X1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGCCQ9H4X1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGCCQ9H4X1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGCCQ9H4X1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGCCQ9H4X1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGCCQ9H4X1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGCCQ9H4X1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGCCQ9H4X1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGCCQ9H4X1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGCCQ9H4X1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGCCQ9H4X1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGCCQ9H4X1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGCCQ9H4X1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGCCQ9H4X1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGCCQ9H4X1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGCCQ9H4X1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGCCQ9H4X1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGCCQ9H4X1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGCCQ9H4X1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGCCQ9H4X1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGCCQ9H4X1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms