Protein–RNA interactions for Protein: Q9H305

CDIP1, Cell death-inducing p53-target protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIP1Q9H305 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDIP1Q9H305 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDIP1Q9H305 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDIP1Q9H305 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDIP1Q9H305 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDIP1Q9H305 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDIP1Q9H305 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDIP1Q9H305 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDIP1Q9H305 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDIP1Q9H305 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDIP1Q9H305 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDIP1Q9H305 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDIP1Q9H305 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDIP1Q9H305 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDIP1Q9H305 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDIP1Q9H305 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDIP1Q9H305 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDIP1Q9H305 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDIP1Q9H305 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDIP1Q9H305 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDIP1Q9H305 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDIP1Q9H305 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDIP1Q9H305 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDIP1Q9H305 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDIP1Q9H305 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDIP1Q9H305 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDIP1Q9H305 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDIP1Q9H305 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDIP1Q9H305 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDIP1Q9H305 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDIP1Q9H305 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDIP1Q9H305 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDIP1Q9H305 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDIP1Q9H305 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDIP1Q9H305 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDIP1Q9H305 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDIP1Q9H305 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDIP1Q9H305 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDIP1Q9H305 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDIP1Q9H305 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDIP1Q9H305 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms