Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB17Q9H0T7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB17Q9H0T7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB17Q9H0T7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB17Q9H0T7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB17Q9H0T7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB17Q9H0T7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB17Q9H0T7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB17Q9H0T7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB17Q9H0T7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB17Q9H0T7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB17Q9H0T7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB17Q9H0T7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB17Q9H0T7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB17Q9H0T7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB17Q9H0T7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB17Q9H0T7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB17Q9H0T7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB17Q9H0T7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB17Q9H0T7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB17Q9H0T7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB17Q9H0T7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB17Q9H0T7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB17Q9H0T7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB17Q9H0T7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB17Q9H0T7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB17Q9H0T7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RAB17Q9H0T7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB17Q9H0T7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB17Q9H0T7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB17Q9H0T7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB17Q9H0T7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB17Q9H0T7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB17Q9H0T7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB17Q9H0T7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB17Q9H0T7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB17Q9H0T7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB17Q9H0T7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB17Q9H0T7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB17Q9H0T7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB17Q9H0T7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB17Q9H0T7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB17Q9H0T7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB17Q9H0T7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB17Q9H0T7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB17Q9H0T7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB17Q9H0T7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB17Q9H0T7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB17Q9H0T7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB17Q9H0T7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB17Q9H0T7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB17Q9H0T7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB17Q9H0T7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB17Q9H0T7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB17Q9H0T7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAB17Q9H0T7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB17Q9H0T7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB17Q9H0T7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB17Q9H0T7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB17Q9H0T7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB17Q9H0T7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB17Q9H0T7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB17Q9H0T7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB17Q9H0T7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB17Q9H0T7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB17Q9H0T7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB17Q9H0T7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB17Q9H0T7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB17Q9H0T7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB17Q9H0T7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB17Q9H0T7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB17Q9H0T7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB17Q9H0T7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB17Q9H0T7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RAB17Q9H0T7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAB17Q9H0T7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB17Q9H0T7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB17Q9H0T7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RAB17Q9H0T7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB17Q9H0T7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAB17Q9H0T7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAB17Q9H0T7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAB17Q9H0T7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB17Q9H0T7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB17Q9H0T7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAB17Q9H0T7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAB17Q9H0T7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB17Q9H0T7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB17Q9H0T7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB17Q9H0T7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB17Q9H0T7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB17Q9H0T7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB17Q9H0T7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB17Q9H0T7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB17Q9H0T7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB17Q9H0T7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB17Q9H0T7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB17Q9H0T7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB17Q9H0T7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB17Q9H0T7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms