Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
REXO4Q9GZR2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
REXO4Q9GZR2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
REXO4Q9GZR2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
REXO4Q9GZR2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REXO4Q9GZR2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
REXO4Q9GZR2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
REXO4Q9GZR2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
REXO4Q9GZR2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
REXO4Q9GZR2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
REXO4Q9GZR2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
REXO4Q9GZR2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
REXO4Q9GZR2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REXO4Q9GZR2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
REXO4Q9GZR2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
REXO4Q9GZR2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
REXO4Q9GZR2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
REXO4Q9GZR2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
REXO4Q9GZR2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
REXO4Q9GZR2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
REXO4Q9GZR2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
REXO4Q9GZR2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
REXO4Q9GZR2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
REXO4Q9GZR2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
REXO4Q9GZR2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REXO4Q9GZR2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
REXO4Q9GZR2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
REXO4Q9GZR2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
REXO4Q9GZR2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
REXO4Q9GZR2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
REXO4Q9GZR2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
REXO4Q9GZR2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
REXO4Q9GZR2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
REXO4Q9GZR2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
REXO4Q9GZR2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
REXO4Q9GZR2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
REXO4Q9GZR2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
REXO4Q9GZR2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
REXO4Q9GZR2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
REXO4Q9GZR2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
REXO4Q9GZR2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
REXO4Q9GZR2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
REXO4Q9GZR2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
REXO4Q9GZR2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
REXO4Q9GZR2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
REXO4Q9GZR2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO4Q9GZR2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO4Q9GZR2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO4Q9GZR2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO4Q9GZR2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
REXO4Q9GZR2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
REXO4Q9GZR2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
REXO4Q9GZR2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
REXO4Q9GZR2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
REXO4Q9GZR2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
REXO4Q9GZR2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
REXO4Q9GZR2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
REXO4Q9GZR2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
REXO4Q9GZR2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
REXO4Q9GZR2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
REXO4Q9GZR2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
REXO4Q9GZR2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
REXO4Q9GZR2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
REXO4Q9GZR2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
REXO4Q9GZR2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
REXO4Q9GZR2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
REXO4Q9GZR2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
REXO4Q9GZR2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
REXO4Q9GZR2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
REXO4Q9GZR2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
REXO4Q9GZR2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
REXO4Q9GZR2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
REXO4Q9GZR2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
REXO4Q9GZR2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
REXO4Q9GZR2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
REXO4Q9GZR2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
REXO4Q9GZR2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
REXO4Q9GZR2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
REXO4Q9GZR2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
REXO4Q9GZR2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
REXO4Q9GZR2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
REXO4Q9GZR2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REXO4Q9GZR2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
REXO4Q9GZR2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
REXO4Q9GZR2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
REXO4Q9GZR2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
REXO4Q9GZR2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
REXO4Q9GZR2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms