Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP1-5Q9BYS1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KRTAP1-5Q9BYS1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRTAP1-5Q9BYS1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KRTAP1-5Q9BYS1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRTAP1-5Q9BYS1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRTAP1-5Q9BYS1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KRTAP1-5Q9BYS1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRTAP1-5Q9BYS1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KRTAP1-5Q9BYS1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRTAP1-5Q9BYS1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRTAP1-5Q9BYS1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KRTAP1-5Q9BYS1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KRTAP1-5Q9BYS1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRTAP1-5Q9BYS1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRTAP1-5Q9BYS1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRTAP1-5Q9BYS1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms