Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
HIRIP3Q9BW71 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
HIRIP3Q9BW71 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
HIRIP3Q9BW71 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
HIRIP3Q9BW71 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
HIRIP3Q9BW71 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
HIRIP3Q9BW71 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
HIRIP3Q9BW71 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
HIRIP3Q9BW71 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HIRIP3Q9BW71 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HIRIP3Q9BW71 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HIRIP3Q9BW71 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
HIRIP3Q9BW71 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
HIRIP3Q9BW71 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
HIRIP3Q9BW71 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
HIRIP3Q9BW71 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
HIRIP3Q9BW71 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
HIRIP3Q9BW71 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
HIRIP3Q9BW71 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
HIRIP3Q9BW71 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
HIRIP3Q9BW71 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
HIRIP3Q9BW71 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
HIRIP3Q9BW71 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
HIRIP3Q9BW71 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
HIRIP3Q9BW71 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
HIRIP3Q9BW71 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
HIRIP3Q9BW71 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
HIRIP3Q9BW71 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
HIRIP3Q9BW71 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
HIRIP3Q9BW71 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
HIRIP3Q9BW71 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
HIRIP3Q9BW71 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
HIRIP3Q9BW71 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
HIRIP3Q9BW71 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
HIRIP3Q9BW71 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
HIRIP3Q9BW71 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
HIRIP3Q9BW71 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
HIRIP3Q9BW71 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
HIRIP3Q9BW71 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
HIRIP3Q9BW71 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
HIRIP3Q9BW71 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
HIRIP3Q9BW71 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
HIRIP3Q9BW71 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
HIRIP3Q9BW71 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
HIRIP3Q9BW71 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
HIRIP3Q9BW71 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
HIRIP3Q9BW71 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
HIRIP3Q9BW71 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
HIRIP3Q9BW71 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
HIRIP3Q9BW71 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
HIRIP3Q9BW71 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
HIRIP3Q9BW71 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
HIRIP3Q9BW71 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
HIRIP3Q9BW71 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
HIRIP3Q9BW71 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
HIRIP3Q9BW71 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.48■■■■□ 3.91
HIRIP3Q9BW71 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
HIRIP3Q9BW71 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
HIRIP3Q9BW71 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
HIRIP3Q9BW71 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
HIRIP3Q9BW71 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
HIRIP3Q9BW71 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
HIRIP3Q9BW71 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
HIRIP3Q9BW71 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
HIRIP3Q9BW71 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
HIRIP3Q9BW71 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
HIRIP3Q9BW71 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
HIRIP3Q9BW71 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
HIRIP3Q9BW71 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
HIRIP3Q9BW71 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
HIRIP3Q9BW71 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
HIRIP3Q9BW71 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
HIRIP3Q9BW71 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
HIRIP3Q9BW71 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
HIRIP3Q9BW71 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
HIRIP3Q9BW71 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
HIRIP3Q9BW71 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
HIRIP3Q9BW71 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
HIRIP3Q9BW71 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
HIRIP3Q9BW71 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
HIRIP3Q9BW71 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
HIRIP3Q9BW71 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
HIRIP3Q9BW71 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
HIRIP3Q9BW71 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
HIRIP3Q9BW71 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
HIRIP3Q9BW71 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
HIRIP3Q9BW71 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
HIRIP3Q9BW71 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
HIRIP3Q9BW71 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
HIRIP3Q9BW71 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
HIRIP3Q9BW71 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
HIRIP3Q9BW71 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
HIRIP3Q9BW71 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
HIRIP3Q9BW71 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
HIRIP3Q9BW71 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
HIRIP3Q9BW71 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
HIRIP3Q9BW71 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
HIRIP3Q9BW71 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
HIRIP3Q9BW71 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms