Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRDL1Q9BU40 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRDL1Q9BU40 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRDL1Q9BU40 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRDL1Q9BU40 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRDL1Q9BU40 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRDL1Q9BU40 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRDL1Q9BU40 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRDL1Q9BU40 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRDL1Q9BU40 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRDL1Q9BU40 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRDL1Q9BU40 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRDL1Q9BU40 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRDL1Q9BU40 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRDL1Q9BU40 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRDL1Q9BU40 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRDL1Q9BU40 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRDL1Q9BU40 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRDL1Q9BU40 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRDL1Q9BU40 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRDL1Q9BU40 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRDL1Q9BU40 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRDL1Q9BU40 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRDL1Q9BU40 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRDL1Q9BU40 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRDL1Q9BU40 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRDL1Q9BU40 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRDL1Q9BU40 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRDL1Q9BU40 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRDL1Q9BU40 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRDL1Q9BU40 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRDL1Q9BU40 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRDL1Q9BU40 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRDL1Q9BU40 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRDL1Q9BU40 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRDL1Q9BU40 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms