Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NICN1Q9BSH3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NICN1Q9BSH3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NICN1Q9BSH3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NICN1Q9BSH3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NICN1Q9BSH3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NICN1Q9BSH3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NICN1Q9BSH3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NICN1Q9BSH3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NICN1Q9BSH3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NICN1Q9BSH3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NICN1Q9BSH3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NICN1Q9BSH3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NICN1Q9BSH3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NICN1Q9BSH3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NICN1Q9BSH3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NICN1Q9BSH3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NICN1Q9BSH3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NICN1Q9BSH3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NICN1Q9BSH3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NICN1Q9BSH3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NICN1Q9BSH3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NICN1Q9BSH3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NICN1Q9BSH3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NICN1Q9BSH3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NICN1Q9BSH3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NICN1Q9BSH3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NICN1Q9BSH3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NICN1Q9BSH3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NICN1Q9BSH3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NICN1Q9BSH3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NICN1Q9BSH3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NICN1Q9BSH3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NICN1Q9BSH3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NICN1Q9BSH3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NICN1Q9BSH3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NICN1Q9BSH3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NICN1Q9BSH3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NICN1Q9BSH3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NICN1Q9BSH3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NICN1Q9BSH3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NICN1Q9BSH3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NICN1Q9BSH3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NICN1Q9BSH3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NICN1Q9BSH3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NICN1Q9BSH3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NICN1Q9BSH3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NICN1Q9BSH3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NICN1Q9BSH3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NICN1Q9BSH3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NICN1Q9BSH3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NICN1Q9BSH3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NICN1Q9BSH3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212 ms