Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EIF3CQ99613 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF3CQ99613 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF3CQ99613 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EIF3CQ99613 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
EIF3CQ99613 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EIF3CQ99613 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EIF3CQ99613 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
EIF3CQ99613 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF3CQ99613 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF3CQ99613 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EIF3CQ99613 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EIF3CQ99613 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EIF3CQ99613 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EIF3CQ99613 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
EIF3CQ99613 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EIF3CQ99613 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
EIF3CQ99613 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EIF3CQ99613 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EIF3CQ99613 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EIF3CQ99613 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EIF3CQ99613 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EIF3CQ99613 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EIF3CQ99613 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EIF3CQ99613 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EIF3CQ99613 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EIF3CQ99613 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EIF3CQ99613 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EIF3CQ99613 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EIF3CQ99613 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EIF3CQ99613 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EIF3CQ99613 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EIF3CQ99613 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EIF3CQ99613 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
EIF3CQ99613 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EIF3CQ99613 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EIF3CQ99613 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EIF3CQ99613 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EIF3CQ99613 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF3CQ99613 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EIF3CQ99613 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EIF3CQ99613 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EIF3CQ99613 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EIF3CQ99613 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EIF3CQ99613 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EIF3CQ99613 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EIF3CQ99613 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EIF3CQ99613 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EIF3CQ99613 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EIF3CQ99613 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EIF3CQ99613 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EIF3CQ99613 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EIF3CQ99613 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EIF3CQ99613 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EIF3CQ99613 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EIF3CQ99613 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EIF3CQ99613 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EIF3CQ99613 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EIF3CQ99613 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EIF3CQ99613 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EIF3CQ99613 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EIF3CQ99613 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EIF3CQ99613 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
EIF3CQ99613 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EIF3CQ99613 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EIF3CQ99613 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EIF3CQ99613 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
EIF3CQ99613 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EIF3CQ99613 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EIF3CQ99613 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EIF3CQ99613 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EIF3CQ99613 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EIF3CQ99613 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EIF3CQ99613 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EIF3CQ99613 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EIF3CQ99613 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EIF3CQ99613 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EIF3CQ99613 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EIF3CQ99613 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EIF3CQ99613 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EIF3CQ99613 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EIF3CQ99613 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
EIF3CQ99613 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EIF3CQ99613 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EIF3CQ99613 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms