Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXN4Q96NZ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXN4Q96NZ1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXN4Q96NZ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN4Q96NZ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXN4Q96NZ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN4Q96NZ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN4Q96NZ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXN4Q96NZ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN4Q96NZ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN4Q96NZ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXN4Q96NZ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXN4Q96NZ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN4Q96NZ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXN4Q96NZ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXN4Q96NZ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN4Q96NZ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXN4Q96NZ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXN4Q96NZ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN4Q96NZ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXN4Q96NZ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN4Q96NZ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN4Q96NZ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXN4Q96NZ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXN4Q96NZ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN4Q96NZ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN4Q96NZ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN4Q96NZ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN4Q96NZ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN4Q96NZ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN4Q96NZ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN4Q96NZ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN4Q96NZ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN4Q96NZ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN4Q96NZ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN4Q96NZ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN4Q96NZ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXN4Q96NZ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXN4Q96NZ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXN4Q96NZ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXN4Q96NZ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXN4Q96NZ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXN4Q96NZ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FOXN4Q96NZ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FOXN4Q96NZ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FOXN4Q96NZ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXN4Q96NZ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXN4Q96NZ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXN4Q96NZ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FOXN4Q96NZ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FOXN4Q96NZ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXN4Q96NZ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXN4Q96NZ1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXN4Q96NZ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXN4Q96NZ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXN4Q96NZ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXN4Q96NZ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXN4Q96NZ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXN4Q96NZ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXN4Q96NZ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXN4Q96NZ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXN4Q96NZ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXN4Q96NZ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXN4Q96NZ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN4Q96NZ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXN4Q96NZ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN4Q96NZ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN4Q96NZ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN4Q96NZ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN4Q96NZ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN4Q96NZ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN4Q96NZ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms