Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUNDC3BQ96NL0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC3BQ96NL0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC3BQ96NL0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC3BQ96NL0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC3BQ96NL0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUNDC3BQ96NL0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC3BQ96NL0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUNDC3BQ96NL0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUNDC3BQ96NL0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUNDC3BQ96NL0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUNDC3BQ96NL0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RUNDC3BQ96NL0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC3BQ96NL0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC3BQ96NL0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RUNDC3BQ96NL0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RUNDC3BQ96NL0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RUNDC3BQ96NL0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RUNDC3BQ96NL0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUNDC3BQ96NL0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUNDC3BQ96NL0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RUNDC3BQ96NL0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RUNDC3BQ96NL0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUNDC3BQ96NL0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUNDC3BQ96NL0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RUNDC3BQ96NL0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RUNDC3BQ96NL0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUNDC3BQ96NL0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUNDC3BQ96NL0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RUNDC3BQ96NL0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RUNDC3BQ96NL0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RUNDC3BQ96NL0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RUNDC3BQ96NL0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RUNDC3BQ96NL0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUNDC3BQ96NL0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUNDC3BQ96NL0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC3BQ96NL0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUNDC3BQ96NL0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUNDC3BQ96NL0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUNDC3BQ96NL0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUNDC3BQ96NL0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC3BQ96NL0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUNDC3BQ96NL0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUNDC3BQ96NL0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC3BQ96NL0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC3BQ96NL0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUNDC3BQ96NL0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUNDC3BQ96NL0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RUNDC3BQ96NL0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUNDC3BQ96NL0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC3BQ96NL0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC3BQ96NL0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUNDC3BQ96NL0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC3BQ96NL0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC3BQ96NL0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUNDC3BQ96NL0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUNDC3BQ96NL0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUNDC3BQ96NL0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC3BQ96NL0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUNDC3BQ96NL0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RUNDC3BQ96NL0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUNDC3BQ96NL0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUNDC3BQ96NL0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC3BQ96NL0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC3BQ96NL0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC3BQ96NL0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC3BQ96NL0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUNDC3BQ96NL0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUNDC3BQ96NL0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUNDC3BQ96NL0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC3BQ96NL0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUNDC3BQ96NL0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 788.1 ms