Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00477Q96M19 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00477Q96M19 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LINC00477Q96M19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00477Q96M19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LINC00477Q96M19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC00477Q96M19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00477Q96M19 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00477Q96M19 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00477Q96M19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00477Q96M19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00477Q96M19 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00477Q96M19 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00477Q96M19 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00477Q96M19 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00477Q96M19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00477Q96M19 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00477Q96M19 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00477Q96M19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00477Q96M19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LINC00477Q96M19 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00477Q96M19 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00477Q96M19 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00477Q96M19 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00477Q96M19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00477Q96M19 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00477Q96M19 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00477Q96M19 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00477Q96M19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00477Q96M19 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00477Q96M19 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00477Q96M19 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00477Q96M19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00477Q96M19 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00477Q96M19 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00477Q96M19 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00477Q96M19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00477Q96M19 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00477Q96M19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00477Q96M19 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00477Q96M19 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00477Q96M19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00477Q96M19 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00477Q96M19 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00477Q96M19 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00477Q96M19 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00477Q96M19 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00477Q96M19 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00477Q96M19 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00477Q96M19 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00477Q96M19 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00477Q96M19 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00477Q96M19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00477Q96M19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms