Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ACSBG1Q96GR2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ACSBG1Q96GR2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
ACSBG1Q96GR2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ACSBG1Q96GR2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ACSBG1Q96GR2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ACSBG1Q96GR2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ACSBG1Q96GR2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ACSBG1Q96GR2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
ACSBG1Q96GR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ACSBG1Q96GR2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ACSBG1Q96GR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
ACSBG1Q96GR2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
ACSBG1Q96GR2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ACSBG1Q96GR2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ACSBG1Q96GR2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ACSBG1Q96GR2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ACSBG1Q96GR2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ACSBG1Q96GR2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ACSBG1Q96GR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ACSBG1Q96GR2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ACSBG1Q96GR2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ACSBG1Q96GR2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ACSBG1Q96GR2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ACSBG1Q96GR2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ACSBG1Q96GR2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
ACSBG1Q96GR2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ACSBG1Q96GR2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ACSBG1Q96GR2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ACSBG1Q96GR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
ACSBG1Q96GR2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ACSBG1Q96GR2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
ACSBG1Q96GR2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ACSBG1Q96GR2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ACSBG1Q96GR2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ACSBG1Q96GR2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ACSBG1Q96GR2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ACSBG1Q96GR2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ACSBG1Q96GR2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ACSBG1Q96GR2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ACSBG1Q96GR2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ACSBG1Q96GR2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
ACSBG1Q96GR2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ACSBG1Q96GR2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ACSBG1Q96GR2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ACSBG1Q96GR2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ACSBG1Q96GR2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
ACSBG1Q96GR2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ACSBG1Q96GR2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ACSBG1Q96GR2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ACSBG1Q96GR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ACSBG1Q96GR2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ACSBG1Q96GR2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ACSBG1Q96GR2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ACSBG1Q96GR2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ACSBG1Q96GR2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ACSBG1Q96GR2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ACSBG1Q96GR2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
ACSBG1Q96GR2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ACSBG1Q96GR2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ACSBG1Q96GR2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ACSBG1Q96GR2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ACSBG1Q96GR2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ACSBG1Q96GR2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ACSBG1Q96GR2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ACSBG1Q96GR2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ACSBG1Q96GR2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ACSBG1Q96GR2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
ACSBG1Q96GR2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ACSBG1Q96GR2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ACSBG1Q96GR2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ACSBG1Q96GR2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ACSBG1Q96GR2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ACSBG1Q96GR2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ACSBG1Q96GR2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ACSBG1Q96GR2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ACSBG1Q96GR2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ACSBG1Q96GR2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ACSBG1Q96GR2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ACSBG1Q96GR2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ACSBG1Q96GR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ACSBG1Q96GR2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ACSBG1Q96GR2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ACSBG1Q96GR2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ACSBG1Q96GR2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ACSBG1Q96GR2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ACSBG1Q96GR2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ACSBG1Q96GR2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ACSBG1Q96GR2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ACSBG1Q96GR2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ACSBG1Q96GR2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ACSBG1Q96GR2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ACSBG1Q96GR2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ACSBG1Q96GR2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ACSBG1Q96GR2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ACSBG1Q96GR2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ACSBG1Q96GR2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ACSBG1Q96GR2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ACSBG1Q96GR2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ACSBG1Q96GR2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms