Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PIK3IP1Q96FE7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3IP1Q96FE7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3IP1Q96FE7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3IP1Q96FE7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3IP1Q96FE7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3IP1Q96FE7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3IP1Q96FE7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3IP1Q96FE7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3IP1Q96FE7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIK3IP1Q96FE7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3IP1Q96FE7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3IP1Q96FE7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIK3IP1Q96FE7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3IP1Q96FE7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3IP1Q96FE7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3IP1Q96FE7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3IP1Q96FE7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3IP1Q96FE7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3IP1Q96FE7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3IP1Q96FE7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3IP1Q96FE7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3IP1Q96FE7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3IP1Q96FE7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIK3IP1Q96FE7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3IP1Q96FE7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIK3IP1Q96FE7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3IP1Q96FE7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIK3IP1Q96FE7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3IP1Q96FE7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3IP1Q96FE7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3IP1Q96FE7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIK3IP1Q96FE7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3IP1Q96FE7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIK3IP1Q96FE7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3IP1Q96FE7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIK3IP1Q96FE7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3IP1Q96FE7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3IP1Q96FE7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3IP1Q96FE7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3IP1Q96FE7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3IP1Q96FE7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3IP1Q96FE7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3IP1Q96FE7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3IP1Q96FE7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3IP1Q96FE7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIK3IP1Q96FE7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3IP1Q96FE7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIK3IP1Q96FE7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3IP1Q96FE7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIK3IP1Q96FE7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3IP1Q96FE7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3IP1Q96FE7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3IP1Q96FE7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIK3IP1Q96FE7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3IP1Q96FE7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIK3IP1Q96FE7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3IP1Q96FE7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIK3IP1Q96FE7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3IP1Q96FE7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms