Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ECHDC3Q96DC8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ECHDC3Q96DC8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHDC3Q96DC8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ECHDC3Q96DC8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ECHDC3Q96DC8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC3Q96DC8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC3Q96DC8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC3Q96DC8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHDC3Q96DC8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECHDC3Q96DC8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECHDC3Q96DC8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHDC3Q96DC8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECHDC3Q96DC8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC3Q96DC8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC3Q96DC8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC3Q96DC8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC3Q96DC8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC3Q96DC8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ECHDC3Q96DC8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ECHDC3Q96DC8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ECHDC3Q96DC8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ECHDC3Q96DC8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC3Q96DC8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC3Q96DC8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ECHDC3Q96DC8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECHDC3Q96DC8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ECHDC3Q96DC8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECHDC3Q96DC8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECHDC3Q96DC8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECHDC3Q96DC8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECHDC3Q96DC8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECHDC3Q96DC8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECHDC3Q96DC8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECHDC3Q96DC8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ECHDC3Q96DC8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECHDC3Q96DC8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECHDC3Q96DC8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECHDC3Q96DC8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECHDC3Q96DC8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECHDC3Q96DC8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHDC3Q96DC8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHDC3Q96DC8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ECHDC3Q96DC8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ECHDC3Q96DC8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ECHDC3Q96DC8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECHDC3Q96DC8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECHDC3Q96DC8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ECHDC3Q96DC8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECHDC3Q96DC8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ECHDC3Q96DC8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECHDC3Q96DC8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECHDC3Q96DC8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ECHDC3Q96DC8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ECHDC3Q96DC8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ECHDC3Q96DC8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ECHDC3Q96DC8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ECHDC3Q96DC8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ECHDC3Q96DC8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ECHDC3Q96DC8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ECHDC3Q96DC8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ECHDC3Q96DC8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECHDC3Q96DC8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECHDC3Q96DC8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ECHDC3Q96DC8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ECHDC3Q96DC8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECHDC3Q96DC8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ECHDC3Q96DC8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ECHDC3Q96DC8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ECHDC3Q96DC8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ECHDC3Q96DC8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC3Q96DC8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC3Q96DC8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ECHDC3Q96DC8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ECHDC3Q96DC8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ECHDC3Q96DC8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECHDC3Q96DC8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECHDC3Q96DC8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECHDC3Q96DC8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ECHDC3Q96DC8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECHDC3Q96DC8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ECHDC3Q96DC8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ECHDC3Q96DC8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ECHDC3Q96DC8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms