Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RMDN1Q96DB5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RMDN1Q96DB5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RMDN1Q96DB5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RMDN1Q96DB5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RMDN1Q96DB5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RMDN1Q96DB5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RMDN1Q96DB5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RMDN1Q96DB5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RMDN1Q96DB5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RMDN1Q96DB5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RMDN1Q96DB5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RMDN1Q96DB5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RMDN1Q96DB5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RMDN1Q96DB5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RMDN1Q96DB5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RMDN1Q96DB5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RMDN1Q96DB5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RMDN1Q96DB5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RMDN1Q96DB5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RMDN1Q96DB5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RMDN1Q96DB5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RMDN1Q96DB5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RMDN1Q96DB5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RMDN1Q96DB5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RMDN1Q96DB5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RMDN1Q96DB5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RMDN1Q96DB5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RMDN1Q96DB5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RMDN1Q96DB5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RMDN1Q96DB5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RMDN1Q96DB5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RMDN1Q96DB5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RMDN1Q96DB5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RMDN1Q96DB5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RMDN1Q96DB5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RMDN1Q96DB5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RMDN1Q96DB5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RMDN1Q96DB5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RMDN1Q96DB5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RMDN1Q96DB5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RMDN1Q96DB5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RMDN1Q96DB5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RMDN1Q96DB5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RMDN1Q96DB5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RMDN1Q96DB5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RMDN1Q96DB5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RMDN1Q96DB5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RMDN1Q96DB5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RMDN1Q96DB5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RMDN1Q96DB5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RMDN1Q96DB5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RMDN1Q96DB5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RMDN1Q96DB5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RMDN1Q96DB5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RMDN1Q96DB5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RMDN1Q96DB5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RMDN1Q96DB5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RMDN1Q96DB5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RMDN1Q96DB5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RMDN1Q96DB5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RMDN1Q96DB5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RMDN1Q96DB5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RMDN1Q96DB5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RMDN1Q96DB5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RMDN1Q96DB5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RMDN1Q96DB5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RMDN1Q96DB5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RMDN1Q96DB5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RMDN1Q96DB5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RMDN1Q96DB5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RMDN1Q96DB5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RMDN1Q96DB5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RMDN1Q96DB5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RMDN1Q96DB5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RMDN1Q96DB5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RMDN1Q96DB5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RMDN1Q96DB5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RMDN1Q96DB5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RMDN1Q96DB5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RMDN1Q96DB5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RMDN1Q96DB5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RMDN1Q96DB5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RMDN1Q96DB5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RMDN1Q96DB5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RMDN1Q96DB5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RMDN1Q96DB5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RMDN1Q96DB5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RMDN1Q96DB5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RMDN1Q96DB5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RMDN1Q96DB5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RMDN1Q96DB5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RMDN1Q96DB5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RMDN1Q96DB5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RMDN1Q96DB5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RMDN1Q96DB5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RMDN1Q96DB5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RMDN1Q96DB5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RMDN1Q96DB5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RMDN1Q96DB5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms