Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RMDN1Q96DB5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RMDN1Q96DB5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RMDN1Q96DB5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RMDN1Q96DB5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
RMDN1Q96DB5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RMDN1Q96DB5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RMDN1Q96DB5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RMDN1Q96DB5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RMDN1Q96DB5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RMDN1Q96DB5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RMDN1Q96DB5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RMDN1Q96DB5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RMDN1Q96DB5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RMDN1Q96DB5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RMDN1Q96DB5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RMDN1Q96DB5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RMDN1Q96DB5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
RMDN1Q96DB5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RMDN1Q96DB5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RMDN1Q96DB5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RMDN1Q96DB5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
RMDN1Q96DB5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RMDN1Q96DB5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RMDN1Q96DB5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RMDN1Q96DB5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RMDN1Q96DB5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RMDN1Q96DB5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RMDN1Q96DB5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RMDN1Q96DB5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RMDN1Q96DB5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
RMDN1Q96DB5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RMDN1Q96DB5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RMDN1Q96DB5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
RMDN1Q96DB5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RMDN1Q96DB5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RMDN1Q96DB5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RMDN1Q96DB5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RMDN1Q96DB5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RMDN1Q96DB5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RMDN1Q96DB5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RMDN1Q96DB5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RMDN1Q96DB5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RMDN1Q96DB5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RMDN1Q96DB5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RMDN1Q96DB5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RMDN1Q96DB5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RMDN1Q96DB5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RMDN1Q96DB5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RMDN1Q96DB5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
RMDN1Q96DB5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RMDN1Q96DB5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
RMDN1Q96DB5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RMDN1Q96DB5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RMDN1Q96DB5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RMDN1Q96DB5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RMDN1Q96DB5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RMDN1Q96DB5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RMDN1Q96DB5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RMDN1Q96DB5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RMDN1Q96DB5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RMDN1Q96DB5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RMDN1Q96DB5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RMDN1Q96DB5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RMDN1Q96DB5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RMDN1Q96DB5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RMDN1Q96DB5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RMDN1Q96DB5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RMDN1Q96DB5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RMDN1Q96DB5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RMDN1Q96DB5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RMDN1Q96DB5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RMDN1Q96DB5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RMDN1Q96DB5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RMDN1Q96DB5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RMDN1Q96DB5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RMDN1Q96DB5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RMDN1Q96DB5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RMDN1Q96DB5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RMDN1Q96DB5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RMDN1Q96DB5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RMDN1Q96DB5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RMDN1Q96DB5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RMDN1Q96DB5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RMDN1Q96DB5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RMDN1Q96DB5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RMDN1Q96DB5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RMDN1Q96DB5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RMDN1Q96DB5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RMDN1Q96DB5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RMDN1Q96DB5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RMDN1Q96DB5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RMDN1Q96DB5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RMDN1Q96DB5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RMDN1Q96DB5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RMDN1Q96DB5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RMDN1Q96DB5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RMDN1Q96DB5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RMDN1Q96DB5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RMDN1Q96DB5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms