Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTC17Q96AE7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC17Q96AE7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC17Q96AE7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC17Q96AE7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC17Q96AE7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC17Q96AE7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC17Q96AE7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC17Q96AE7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC17Q96AE7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC17Q96AE7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC17Q96AE7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC17Q96AE7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC17Q96AE7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC17Q96AE7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC17Q96AE7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC17Q96AE7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC17Q96AE7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC17Q96AE7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC17Q96AE7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC17Q96AE7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC17Q96AE7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC17Q96AE7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC17Q96AE7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC17Q96AE7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC17Q96AE7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC17Q96AE7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC17Q96AE7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC17Q96AE7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC17Q96AE7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TTC17Q96AE7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC17Q96AE7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTC17Q96AE7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTC17Q96AE7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC17Q96AE7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC17Q96AE7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTC17Q96AE7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTC17Q96AE7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTC17Q96AE7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC17Q96AE7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC17Q96AE7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC17Q96AE7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC17Q96AE7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC17Q96AE7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC17Q96AE7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC17Q96AE7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC17Q96AE7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC17Q96AE7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC17Q96AE7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC17Q96AE7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC17Q96AE7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC17Q96AE7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC17Q96AE7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC17Q96AE7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TTC17Q96AE7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC17Q96AE7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC17Q96AE7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC17Q96AE7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC17Q96AE7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC17Q96AE7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC17Q96AE7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC17Q96AE7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTC17Q96AE7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC17Q96AE7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC17Q96AE7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTC17Q96AE7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC17Q96AE7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC17Q96AE7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms