Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GIPC3Q8TF64 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GIPC3Q8TF64 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GIPC3Q8TF64 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GIPC3Q8TF64 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GIPC3Q8TF64 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GIPC3Q8TF64 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GIPC3Q8TF64 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GIPC3Q8TF64 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GIPC3Q8TF64 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIPC3Q8TF64 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIPC3Q8TF64 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GIPC3Q8TF64 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GIPC3Q8TF64 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GIPC3Q8TF64 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GIPC3Q8TF64 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GIPC3Q8TF64 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GIPC3Q8TF64 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GIPC3Q8TF64 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GIPC3Q8TF64 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GIPC3Q8TF64 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GIPC3Q8TF64 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GIPC3Q8TF64 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GIPC3Q8TF64 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GIPC3Q8TF64 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GIPC3Q8TF64 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GIPC3Q8TF64 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GIPC3Q8TF64 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GIPC3Q8TF64 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GIPC3Q8TF64 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GIPC3Q8TF64 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GIPC3Q8TF64 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GIPC3Q8TF64 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GIPC3Q8TF64 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GIPC3Q8TF64 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GIPC3Q8TF64 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GIPC3Q8TF64 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GIPC3Q8TF64 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GIPC3Q8TF64 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GIPC3Q8TF64 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GIPC3Q8TF64 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GIPC3Q8TF64 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GIPC3Q8TF64 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GIPC3Q8TF64 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
GIPC3Q8TF64 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GIPC3Q8TF64 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GIPC3Q8TF64 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC3Q8TF64 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GIPC3Q8TF64 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GIPC3Q8TF64 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GIPC3Q8TF64 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GIPC3Q8TF64 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GIPC3Q8TF64 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GIPC3Q8TF64 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GIPC3Q8TF64 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GIPC3Q8TF64 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GIPC3Q8TF64 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GIPC3Q8TF64 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC3Q8TF64 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GIPC3Q8TF64 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC3Q8TF64 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GIPC3Q8TF64 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GIPC3Q8TF64 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GIPC3Q8TF64 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC3Q8TF64 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC3Q8TF64 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GIPC3Q8TF64 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GIPC3Q8TF64 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GIPC3Q8TF64 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC3Q8TF64 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GIPC3Q8TF64 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GIPC3Q8TF64 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GIPC3Q8TF64 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GIPC3Q8TF64 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIPC3Q8TF64 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GIPC3Q8TF64 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIPC3Q8TF64 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GIPC3Q8TF64 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC3Q8TF64 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GIPC3Q8TF64 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GIPC3Q8TF64 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC3Q8TF64 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC3Q8TF64 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC3Q8TF64 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC3Q8TF64 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC3Q8TF64 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GIPC3Q8TF64 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms